Protein–RNA interactions for Protein: P23497

SP100, Nuclear autoantigen Sp-100, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 879 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP100P23497 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SP100P23497 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SP100P23497 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SP100P23497 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SP100P23497 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SP100P23497 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SP100P23497 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SP100P23497 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SP100P23497 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SP100P23497 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SP100P23497 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SP100P23497 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SP100P23497 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SP100P23497 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SP100P23497 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SP100P23497 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SP100P23497 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SP100P23497 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SP100P23497 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SP100P23497 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SP100P23497 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SP100P23497 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SP100P23497 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SP100P23497 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SP100P23497 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SP100P23497 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SP100P23497 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SP100P23497 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SP100P23497 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SP100P23497 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SP100P23497 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SP100P23497 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SP100P23497 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SP100P23497 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SP100P23497 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SP100P23497 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SP100P23497 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SP100P23497 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SP100P23497 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SP100P23497 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SP100P23497 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SP100P23497 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SP100P23497 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SP100P23497 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SP100P23497 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SP100P23497 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SP100P23497 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SP100P23497 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SP100P23497 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SP100P23497 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SP100P23497 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SP100P23497 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SP100P23497 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SP100P23497 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SP100P23497 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SP100P23497 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SP100P23497 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SP100P23497 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SP100P23497 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SP100P23497 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SP100P23497 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SP100P23497 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SP100P23497 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SP100P23497 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SP100P23497 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SP100P23497 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SP100P23497 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SP100P23497 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SP100P23497 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SP100P23497 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SP100P23497 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SP100P23497 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SP100P23497 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SP100P23497 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SP100P23497 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SP100P23497 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SP100P23497 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SP100P23497 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SP100P23497 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SP100P23497 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SP100P23497 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SP100P23497 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SP100P23497 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SP100P23497 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SP100P23497 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SP100P23497 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SP100P23497 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SP100P23497 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SP100P23497 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SP100P23497 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SP100P23497 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SP100P23497 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SP100P23497 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SP100P23497 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SP100P23497 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SP100P23497 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SP100P23497 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SP100P23497 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SP100P23497 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SP100P23497 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms