Protein–RNA interactions for Protein: P23258

TUBG1, Tubulin gamma-1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBG1P23258 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBG1P23258 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBG1P23258 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBG1P23258 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBG1P23258 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBG1P23258 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBG1P23258 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBG1P23258 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBG1P23258 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBG1P23258 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBG1P23258 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBG1P23258 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBG1P23258 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBG1P23258 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBG1P23258 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBG1P23258 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBG1P23258 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBG1P23258 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBG1P23258 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBG1P23258 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBG1P23258 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBG1P23258 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBG1P23258 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBG1P23258 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBG1P23258 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBG1P23258 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBG1P23258 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBG1P23258 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBG1P23258 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBG1P23258 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBG1P23258 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBG1P23258 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBG1P23258 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBG1P23258 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBG1P23258 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBG1P23258 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBG1P23258 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBG1P23258 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBG1P23258 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBG1P23258 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBG1P23258 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBG1P23258 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBG1P23258 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBG1P23258 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBG1P23258 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBG1P23258 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBG1P23258 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBG1P23258 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBG1P23258 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBG1P23258 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBG1P23258 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBG1P23258 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBG1P23258 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBG1P23258 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBG1P23258 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBG1P23258 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBG1P23258 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBG1P23258 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBG1P23258 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBG1P23258 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBG1P23258 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBG1P23258 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBG1P23258 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBG1P23258 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBG1P23258 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBG1P23258 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBG1P23258 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBG1P23258 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBG1P23258 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBG1P23258 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBG1P23258 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBG1P23258 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBG1P23258 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBG1P23258 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TUBG1P23258 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TUBG1P23258 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TUBG1P23258 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TUBG1P23258 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TUBG1P23258 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TUBG1P23258 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TUBG1P23258 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TUBG1P23258 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TUBG1P23258 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TUBG1P23258 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TUBG1P23258 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TUBG1P23258 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TUBG1P23258 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TUBG1P23258 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TUBG1P23258 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TUBG1P23258 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TUBG1P23258 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TUBG1P23258 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TUBG1P23258 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TUBG1P23258 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TUBG1P23258 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TUBG1P23258 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TUBG1P23258 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
TUBG1P23258 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TUBG1P23258 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TUBG1P23258 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms