Protein–RNA interactions for Protein: P21399

ACO1, Cytoplasmic aconitate hydratase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACO1P21399 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACO1P21399 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACO1P21399 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACO1P21399 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACO1P21399 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ACO1P21399 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACO1P21399 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACO1P21399 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACO1P21399 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ACO1P21399 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ACO1P21399 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ACO1P21399 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ACO1P21399 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACO1P21399 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ACO1P21399 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ACO1P21399 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACO1P21399 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACO1P21399 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACO1P21399 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACO1P21399 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACO1P21399 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACO1P21399 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACO1P21399 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACO1P21399 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACO1P21399 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACO1P21399 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACO1P21399 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACO1P21399 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACO1P21399 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACO1P21399 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACO1P21399 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACO1P21399 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACO1P21399 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACO1P21399 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACO1P21399 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACO1P21399 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACO1P21399 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACO1P21399 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACO1P21399 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACO1P21399 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACO1P21399 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACO1P21399 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACO1P21399 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACO1P21399 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACO1P21399 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACO1P21399 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACO1P21399 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACO1P21399 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACO1P21399 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACO1P21399 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACO1P21399 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACO1P21399 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACO1P21399 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACO1P21399 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACO1P21399 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ACO1P21399 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACO1P21399 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACO1P21399 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACO1P21399 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACO1P21399 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACO1P21399 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACO1P21399 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACO1P21399 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACO1P21399 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACO1P21399 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACO1P21399 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACO1P21399 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ACO1P21399 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ACO1P21399 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ACO1P21399 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACO1P21399 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACO1P21399 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACO1P21399 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACO1P21399 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACO1P21399 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ACO1P21399 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACO1P21399 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACO1P21399 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACO1P21399 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACO1P21399 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACO1P21399 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACO1P21399 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACO1P21399 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACO1P21399 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACO1P21399 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACO1P21399 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACO1P21399 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ACO1P21399 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACO1P21399 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACO1P21399 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACO1P21399 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACO1P21399 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACO1P21399 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACO1P21399 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ACO1P21399 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACO1P21399 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACO1P21399 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACO1P21399 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACO1P21399 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACO1P21399 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms