Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB4AP20338 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB4AP20338 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB4AP20338 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB4AP20338 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB4AP20338 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB4AP20338 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB4AP20338 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB4AP20338 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB4AP20338 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB4AP20338 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB4AP20338 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB4AP20338 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB4AP20338 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB4AP20338 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB4AP20338 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB4AP20338 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB4AP20338 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB4AP20338 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB4AP20338 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB4AP20338 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB4AP20338 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB4AP20338 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB4AP20338 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB4AP20338 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB4AP20338 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB4AP20338 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB4AP20338 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB4AP20338 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB4AP20338 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB4AP20338 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB4AP20338 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB4AP20338 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB4AP20338 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB4AP20338 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB4AP20338 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB4AP20338 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB4AP20338 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB4AP20338 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB4AP20338 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB4AP20338 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB4AP20338 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB4AP20338 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB4AP20338 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB4AP20338 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB4AP20338 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB4AP20338 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB4AP20338 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB4AP20338 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB4AP20338 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB4AP20338 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB4AP20338 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB4AP20338 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB4AP20338 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB4AP20338 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB4AP20338 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB4AP20338 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB4AP20338 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB4AP20338 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB4AP20338 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB4AP20338 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB4AP20338 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB4AP20338 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB4AP20338 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB4AP20338 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB4AP20338 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB4AP20338 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB4AP20338 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB4AP20338 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB4AP20338 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB4AP20338 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB4AP20338 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB4AP20338 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB4AP20338 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB4AP20338 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB4AP20338 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB4AP20338 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB4AP20338 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB4AP20338 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB4AP20338 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB4AP20338 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
RAB4AP20338 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB4AP20338 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB4AP20338 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB4AP20338 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB4AP20338 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB4AP20338 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB4AP20338 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB4AP20338 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB4AP20338 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB4AP20338 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB4AP20338 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB4AP20338 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB4AP20338 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB4AP20338 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB4AP20338 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB4AP20338 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB4AP20338 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB4AP20338 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB4AP20338 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms