Protein–RNA interactions for Protein: P20138

CD33, Myeloid cell surface antigen CD33, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD33P20138 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD33P20138 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD33P20138 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD33P20138 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD33P20138 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD33P20138 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CD33P20138 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD33P20138 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD33P20138 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD33P20138 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD33P20138 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD33P20138 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD33P20138 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD33P20138 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD33P20138 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD33P20138 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD33P20138 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD33P20138 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD33P20138 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CD33P20138 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD33P20138 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD33P20138 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD33P20138 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD33P20138 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD33P20138 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD33P20138 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD33P20138 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD33P20138 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD33P20138 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD33P20138 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD33P20138 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD33P20138 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD33P20138 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD33P20138 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD33P20138 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD33P20138 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD33P20138 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD33P20138 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD33P20138 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD33P20138 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD33P20138 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD33P20138 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD33P20138 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD33P20138 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD33P20138 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD33P20138 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD33P20138 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD33P20138 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD33P20138 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD33P20138 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD33P20138 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD33P20138 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD33P20138 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD33P20138 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD33P20138 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD33P20138 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD33P20138 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD33P20138 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD33P20138 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD33P20138 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD33P20138 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD33P20138 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD33P20138 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD33P20138 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD33P20138 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CD33P20138 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD33P20138 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD33P20138 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD33P20138 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD33P20138 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD33P20138 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD33P20138 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CD33P20138 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD33P20138 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD33P20138 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD33P20138 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CD33P20138 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CD33P20138 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD33P20138 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD33P20138 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD33P20138 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD33P20138 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD33P20138 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD33P20138 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CD33P20138 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD33P20138 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD33P20138 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD33P20138 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD33P20138 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD33P20138 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CD33P20138 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD33P20138 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD33P20138 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD33P20138 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD33P20138 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD33P20138 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD33P20138 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CD33P20138 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD33P20138 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD33P20138 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms