Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SDSP20132 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SDSP20132 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SDSP20132 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SDSP20132 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SDSP20132 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SDSP20132 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SDSP20132 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SDSP20132 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SDSP20132 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SDSP20132 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SDSP20132 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SDSP20132 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SDSP20132 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SDSP20132 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SDSP20132 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SDSP20132 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SDSP20132 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SDSP20132 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SDSP20132 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SDSP20132 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SDSP20132 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SDSP20132 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SDSP20132 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SDSP20132 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SDSP20132 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SDSP20132 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SDSP20132 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SDSP20132 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SDSP20132 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SDSP20132 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SDSP20132 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SDSP20132 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SDSP20132 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SDSP20132 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SDSP20132 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SDSP20132 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SDSP20132 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SDSP20132 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SDSP20132 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SDSP20132 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
SDSP20132 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
SDSP20132 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SDSP20132 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SDSP20132 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SDSP20132 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SDSP20132 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SDSP20132 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SDSP20132 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SDSP20132 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SDSP20132 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SDSP20132 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SDSP20132 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SDSP20132 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SDSP20132 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SDSP20132 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SDSP20132 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SDSP20132 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SDSP20132 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SDSP20132 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SDSP20132 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SDSP20132 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SDSP20132 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SDSP20132 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SDSP20132 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SDSP20132 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SDSP20132 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SDSP20132 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SDSP20132 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SDSP20132 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SDSP20132 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SDSP20132 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SDSP20132 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SDSP20132 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SDSP20132 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SDSP20132 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SDSP20132 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SDSP20132 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SDSP20132 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SDSP20132 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SDSP20132 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SDSP20132 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SDSP20132 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SDSP20132 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SDSP20132 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SDSP20132 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SDSP20132 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SDSP20132 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SDSP20132 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SDSP20132 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SDSP20132 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SDSP20132 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SDSP20132 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
SDSP20132 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SDSP20132 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SDSP20132 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SDSP20132 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SDSP20132 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SDSP20132 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SDSP20132 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms