Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TFE3P19532 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TFE3P19532 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TFE3P19532 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TFE3P19532 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TFE3P19532 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TFE3P19532 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TFE3P19532 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TFE3P19532 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TFE3P19532 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TFE3P19532 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TFE3P19532 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TFE3P19532 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TFE3P19532 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TFE3P19532 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TFE3P19532 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TFE3P19532 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TFE3P19532 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TFE3P19532 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TFE3P19532 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TFE3P19532 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TFE3P19532 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TFE3P19532 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TFE3P19532 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TFE3P19532 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TFE3P19532 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TFE3P19532 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TFE3P19532 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TFE3P19532 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TFE3P19532 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TFE3P19532 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TFE3P19532 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TFE3P19532 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TFE3P19532 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TFE3P19532 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TFE3P19532 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TFE3P19532 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TFE3P19532 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TFE3P19532 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TFE3P19532 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TFE3P19532 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TFE3P19532 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TFE3P19532 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TFE3P19532 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TFE3P19532 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TFE3P19532 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TFE3P19532 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TFE3P19532 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TFE3P19532 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TFE3P19532 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TFE3P19532 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TFE3P19532 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TFE3P19532 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TFE3P19532 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TFE3P19532 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TFE3P19532 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFE3P19532 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFE3P19532 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFE3P19532 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFE3P19532 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFE3P19532 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFE3P19532 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TFE3P19532 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFE3P19532 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFE3P19532 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TFE3P19532 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TFE3P19532 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TFE3P19532 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TFE3P19532 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TFE3P19532 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TFE3P19532 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TFE3P19532 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TFE3P19532 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TFE3P19532 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TFE3P19532 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TFE3P19532 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TFE3P19532 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TFE3P19532 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TFE3P19532 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TFE3P19532 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TFE3P19532 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TFE3P19532 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TFE3P19532 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TFE3P19532 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TFE3P19532 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TFE3P19532 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TFE3P19532 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TFE3P19532 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TFE3P19532 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TFE3P19532 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TFE3P19532 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TFE3P19532 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TFE3P19532 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TFE3P19532 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TFE3P19532 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TFE3P19532 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TFE3P19532 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TFE3P19532 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TFE3P19532 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TFE3P19532 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms