Protein–RNA interactions for Protein: P19447

ERCC3, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC3P19447 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERCC3P19447 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ERCC3P19447 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ERCC3P19447 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ERCC3P19447 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ERCC3P19447 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ERCC3P19447 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ERCC3P19447 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ERCC3P19447 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ERCC3P19447 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERCC3P19447 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERCC3P19447 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERCC3P19447 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERCC3P19447 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERCC3P19447 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ERCC3P19447 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERCC3P19447 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERCC3P19447 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERCC3P19447 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERCC3P19447 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERCC3P19447 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERCC3P19447 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERCC3P19447 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ERCC3P19447 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERCC3P19447 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERCC3P19447 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERCC3P19447 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERCC3P19447 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERCC3P19447 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERCC3P19447 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERCC3P19447 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ERCC3P19447 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERCC3P19447 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERCC3P19447 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ERCC3P19447 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERCC3P19447 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERCC3P19447 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERCC3P19447 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERCC3P19447 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ERCC3P19447 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERCC3P19447 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERCC3P19447 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERCC3P19447 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERCC3P19447 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERCC3P19447 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERCC3P19447 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERCC3P19447 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERCC3P19447 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERCC3P19447 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERCC3P19447 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ERCC3P19447 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERCC3P19447 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERCC3P19447 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERCC3P19447 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERCC3P19447 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERCC3P19447 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERCC3P19447 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERCC3P19447 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERCC3P19447 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERCC3P19447 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERCC3P19447 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERCC3P19447 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERCC3P19447 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERCC3P19447 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERCC3P19447 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERCC3P19447 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERCC3P19447 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERCC3P19447 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERCC3P19447 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERCC3P19447 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERCC3P19447 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERCC3P19447 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERCC3P19447 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERCC3P19447 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERCC3P19447 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERCC3P19447 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERCC3P19447 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ERCC3P19447 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERCC3P19447 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERCC3P19447 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERCC3P19447 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERCC3P19447 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ERCC3P19447 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERCC3P19447 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERCC3P19447 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERCC3P19447 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERCC3P19447 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERCC3P19447 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERCC3P19447 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERCC3P19447 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERCC3P19447 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERCC3P19447 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERCC3P19447 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERCC3P19447 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERCC3P19447 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERCC3P19447 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERCC3P19447 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ERCC3P19447 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERCC3P19447 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ERCC3P19447 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms