Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRAP18433 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRAP18433 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRAP18433 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRAP18433 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRAP18433 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRAP18433 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRAP18433 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRAP18433 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRAP18433 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRAP18433 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRAP18433 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRAP18433 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTPRAP18433 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRAP18433 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRAP18433 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms