Protein–RNA interactions for Protein: P17544

ATF7, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7P17544 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATF7P17544 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATF7P17544 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATF7P17544 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATF7P17544 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATF7P17544 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATF7P17544 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATF7P17544 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATF7P17544 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATF7P17544 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATF7P17544 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATF7P17544 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATF7P17544 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ATF7P17544 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATF7P17544 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATF7P17544 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATF7P17544 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATF7P17544 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATF7P17544 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATF7P17544 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATF7P17544 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATF7P17544 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATF7P17544 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATF7P17544 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ATF7P17544 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATF7P17544 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATF7P17544 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATF7P17544 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATF7P17544 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATF7P17544 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATF7P17544 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATF7P17544 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATF7P17544 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATF7P17544 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATF7P17544 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATF7P17544 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATF7P17544 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATF7P17544 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ATF7P17544 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATF7P17544 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATF7P17544 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATF7P17544 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATF7P17544 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATF7P17544 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ATF7P17544 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ATF7P17544 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ATF7P17544 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATF7P17544 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATF7P17544 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATF7P17544 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATF7P17544 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATF7P17544 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ATF7P17544 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATF7P17544 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATF7P17544 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATF7P17544 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATF7P17544 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATF7P17544 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ATF7P17544 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATF7P17544 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATF7P17544 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATF7P17544 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATF7P17544 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATF7P17544 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATF7P17544 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATF7P17544 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATF7P17544 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATF7P17544 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ATF7P17544 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATF7P17544 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATF7P17544 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATF7P17544 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATF7P17544 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATF7P17544 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATF7P17544 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATF7P17544 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ATF7P17544 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATF7P17544 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATF7P17544 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATF7P17544 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATF7P17544 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATF7P17544 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATF7P17544 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATF7P17544 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATF7P17544 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATF7P17544 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATF7P17544 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ATF7P17544 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATF7P17544 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATF7P17544 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATF7P17544 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATF7P17544 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATF7P17544 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATF7P17544 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATF7P17544 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATF7P17544 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATF7P17544 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATF7P17544 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATF7P17544 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATF7P17544 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms