Protein–RNA interactions for Protein: P16871

IL7R, Interleukin-7 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL7RP16871 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IL7RP16871 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IL7RP16871 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IL7RP16871 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IL7RP16871 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IL7RP16871 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IL7RP16871 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IL7RP16871 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IL7RP16871 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IL7RP16871 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IL7RP16871 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
IL7RP16871 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IL7RP16871 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IL7RP16871 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IL7RP16871 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IL7RP16871 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IL7RP16871 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IL7RP16871 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IL7RP16871 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
IL7RP16871 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IL7RP16871 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IL7RP16871 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IL7RP16871 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IL7RP16871 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IL7RP16871 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IL7RP16871 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
IL7RP16871 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IL7RP16871 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IL7RP16871 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IL7RP16871 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IL7RP16871 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IL7RP16871 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IL7RP16871 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IL7RP16871 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IL7RP16871 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
IL7RP16871 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IL7RP16871 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IL7RP16871 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IL7RP16871 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IL7RP16871 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IL7RP16871 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IL7RP16871 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IL7RP16871 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IL7RP16871 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IL7RP16871 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IL7RP16871 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IL7RP16871 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
IL7RP16871 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IL7RP16871 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IL7RP16871 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IL7RP16871 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IL7RP16871 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IL7RP16871 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IL7RP16871 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IL7RP16871 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IL7RP16871 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IL7RP16871 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IL7RP16871 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IL7RP16871 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IL7RP16871 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IL7RP16871 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IL7RP16871 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IL7RP16871 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
IL7RP16871 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IL7RP16871 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IL7RP16871 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IL7RP16871 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IL7RP16871 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
IL7RP16871 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IL7RP16871 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IL7RP16871 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IL7RP16871 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IL7RP16871 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
IL7RP16871 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IL7RP16871 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IL7RP16871 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IL7RP16871 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IL7RP16871 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IL7RP16871 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IL7RP16871 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IL7RP16871 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IL7RP16871 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IL7RP16871 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IL7RP16871 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IL7RP16871 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IL7RP16871 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IL7RP16871 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IL7RP16871 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IL7RP16871 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IL7RP16871 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IL7RP16871 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IL7RP16871 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IL7RP16871 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IL7RP16871 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IL7RP16871 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IL7RP16871 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IL7RP16871 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IL7RP16871 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IL7RP16871 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IL7RP16871 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms