Protein–RNA interactions for Protein: P16499

PDE6A, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6AP16499 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDE6AP16499 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PDE6AP16499 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDE6AP16499 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDE6AP16499 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDE6AP16499 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDE6AP16499 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PDE6AP16499 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDE6AP16499 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDE6AP16499 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDE6AP16499 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDE6AP16499 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDE6AP16499 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDE6AP16499 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDE6AP16499 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDE6AP16499 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDE6AP16499 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDE6AP16499 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDE6AP16499 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDE6AP16499 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDE6AP16499 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDE6AP16499 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDE6AP16499 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDE6AP16499 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PDE6AP16499 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDE6AP16499 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDE6AP16499 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDE6AP16499 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDE6AP16499 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDE6AP16499 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDE6AP16499 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDE6AP16499 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDE6AP16499 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PDE6AP16499 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDE6AP16499 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDE6AP16499 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDE6AP16499 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDE6AP16499 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDE6AP16499 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDE6AP16499 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDE6AP16499 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDE6AP16499 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDE6AP16499 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDE6AP16499 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDE6AP16499 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDE6AP16499 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDE6AP16499 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDE6AP16499 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDE6AP16499 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDE6AP16499 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDE6AP16499 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PDE6AP16499 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PDE6AP16499 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PDE6AP16499 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PDE6AP16499 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDE6AP16499 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDE6AP16499 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PDE6AP16499 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDE6AP16499 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDE6AP16499 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDE6AP16499 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDE6AP16499 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDE6AP16499 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDE6AP16499 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDE6AP16499 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDE6AP16499 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDE6AP16499 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PDE6AP16499 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDE6AP16499 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDE6AP16499 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDE6AP16499 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PDE6AP16499 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PDE6AP16499 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDE6AP16499 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDE6AP16499 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDE6AP16499 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDE6AP16499 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDE6AP16499 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDE6AP16499 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDE6AP16499 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PDE6AP16499 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PDE6AP16499 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PDE6AP16499 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PDE6AP16499 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDE6AP16499 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDE6AP16499 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDE6AP16499 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDE6AP16499 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE6AP16499 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE6AP16499 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE6AP16499 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE6AP16499 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE6AP16499 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE6AP16499 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDE6AP16499 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDE6AP16499 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PDE6AP16499 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDE6AP16499 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDE6AP16499 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDE6AP16499 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms