Protein–RNA interactions for Protein: P15976

GATA1, Erythroid transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA1P15976 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATA1P15976 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATA1P15976 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATA1P15976 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATA1P15976 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATA1P15976 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATA1P15976 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATA1P15976 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATA1P15976 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATA1P15976 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATA1P15976 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATA1P15976 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATA1P15976 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATA1P15976 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATA1P15976 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATA1P15976 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATA1P15976 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATA1P15976 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATA1P15976 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GATA1P15976 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATA1P15976 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATA1P15976 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATA1P15976 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATA1P15976 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATA1P15976 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATA1P15976 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATA1P15976 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATA1P15976 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATA1P15976 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GATA1P15976 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATA1P15976 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GATA1P15976 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GATA1P15976 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GATA1P15976 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GATA1P15976 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GATA1P15976 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GATA1P15976 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GATA1P15976 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GATA1P15976 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GATA1P15976 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GATA1P15976 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GATA1P15976 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GATA1P15976 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GATA1P15976 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GATA1P15976 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GATA1P15976 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GATA1P15976 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GATA1P15976 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GATA1P15976 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GATA1P15976 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GATA1P15976 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GATA1P15976 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GATA1P15976 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GATA1P15976 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GATA1P15976 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GATA1P15976 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATA1P15976 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATA1P15976 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATA1P15976 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATA1P15976 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATA1P15976 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATA1P15976 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATA1P15976 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATA1P15976 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATA1P15976 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATA1P15976 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATA1P15976 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATA1P15976 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATA1P15976 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATA1P15976 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATA1P15976 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATA1P15976 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATA1P15976 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATA1P15976 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATA1P15976 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATA1P15976 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATA1P15976 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATA1P15976 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATA1P15976 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATA1P15976 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATA1P15976 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATA1P15976 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATA1P15976 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATA1P15976 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATA1P15976 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATA1P15976 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATA1P15976 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATA1P15976 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATA1P15976 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATA1P15976 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATA1P15976 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATA1P15976 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATA1P15976 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATA1P15976 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GATA1P15976 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATA1P15976 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATA1P15976 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATA1P15976 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATA1P15976 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATA1P15976 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms