Protein–RNA interactions for Protein: P15918

RAG1, V(D)J recombination-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG1P15918 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAG1P15918 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAG1P15918 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAG1P15918 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAG1P15918 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAG1P15918 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RAG1P15918 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAG1P15918 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAG1P15918 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAG1P15918 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAG1P15918 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAG1P15918 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAG1P15918 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAG1P15918 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAG1P15918 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAG1P15918 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAG1P15918 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAG1P15918 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAG1P15918 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAG1P15918 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAG1P15918 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAG1P15918 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAG1P15918 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAG1P15918 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAG1P15918 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAG1P15918 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAG1P15918 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAG1P15918 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAG1P15918 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAG1P15918 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAG1P15918 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAG1P15918 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAG1P15918 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAG1P15918 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAG1P15918 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAG1P15918 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAG1P15918 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RAG1P15918 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAG1P15918 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAG1P15918 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RAG1P15918 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAG1P15918 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAG1P15918 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAG1P15918 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAG1P15918 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAG1P15918 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAG1P15918 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAG1P15918 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAG1P15918 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAG1P15918 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAG1P15918 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAG1P15918 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAG1P15918 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAG1P15918 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAG1P15918 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAG1P15918 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAG1P15918 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAG1P15918 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAG1P15918 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAG1P15918 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAG1P15918 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAG1P15918 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAG1P15918 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAG1P15918 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAG1P15918 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAG1P15918 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAG1P15918 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAG1P15918 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAG1P15918 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAG1P15918 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAG1P15918 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAG1P15918 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAG1P15918 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAG1P15918 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAG1P15918 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAG1P15918 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAG1P15918 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAG1P15918 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAG1P15918 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAG1P15918 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAG1P15918 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAG1P15918 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAG1P15918 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAG1P15918 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAG1P15918 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAG1P15918 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAG1P15918 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAG1P15918 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAG1P15918 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RAG1P15918 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAG1P15918 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAG1P15918 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAG1P15918 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAG1P15918 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAG1P15918 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAG1P15918 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RAG1P15918 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAG1P15918 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAG1P15918 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAG1P15918 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms