Protein–RNA interactions for Protein: P15884

TCF4, Transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF4P15884 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCF4P15884 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCF4P15884 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCF4P15884 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCF4P15884 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCF4P15884 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCF4P15884 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCF4P15884 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCF4P15884 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCF4P15884 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCF4P15884 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCF4P15884 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCF4P15884 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCF4P15884 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TCF4P15884 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TCF4P15884 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TCF4P15884 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TCF4P15884 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TCF4P15884 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TCF4P15884 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TCF4P15884 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TCF4P15884 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCF4P15884 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCF4P15884 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCF4P15884 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCF4P15884 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCF4P15884 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCF4P15884 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCF4P15884 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCF4P15884 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCF4P15884 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCF4P15884 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCF4P15884 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCF4P15884 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCF4P15884 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TCF4P15884 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCF4P15884 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCF4P15884 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCF4P15884 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCF4P15884 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCF4P15884 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCF4P15884 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCF4P15884 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TCF4P15884 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCF4P15884 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TCF4P15884 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TCF4P15884 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TCF4P15884 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TCF4P15884 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TCF4P15884 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TCF4P15884 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TCF4P15884 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TCF4P15884 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TCF4P15884 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TCF4P15884 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCF4P15884 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCF4P15884 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCF4P15884 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCF4P15884 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCF4P15884 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCF4P15884 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCF4P15884 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCF4P15884 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCF4P15884 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCF4P15884 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TCF4P15884 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCF4P15884 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCF4P15884 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCF4P15884 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCF4P15884 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCF4P15884 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCF4P15884 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCF4P15884 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCF4P15884 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCF4P15884 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCF4P15884 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCF4P15884 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCF4P15884 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCF4P15884 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCF4P15884 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCF4P15884 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCF4P15884 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCF4P15884 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCF4P15884 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCF4P15884 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCF4P15884 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCF4P15884 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCF4P15884 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCF4P15884 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCF4P15884 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCF4P15884 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCF4P15884 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCF4P15884 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCF4P15884 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCF4P15884 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCF4P15884 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TCF4P15884 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCF4P15884 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCF4P15884 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCF4P15884 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms