Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
VEGFAP15692 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
VEGFAP15692 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
VEGFAP15692 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
VEGFAP15692 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
VEGFAP15692 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
VEGFAP15692 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
VEGFAP15692 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
VEGFAP15692 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
VEGFAP15692 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
VEGFAP15692 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VEGFAP15692 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VEGFAP15692 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
VEGFAP15692 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
VEGFAP15692 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
VEGFAP15692 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VEGFAP15692 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VEGFAP15692 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
VEGFAP15692 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
VEGFAP15692 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
VEGFAP15692 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VEGFAP15692 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
VEGFAP15692 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VEGFAP15692 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
VEGFAP15692 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VEGFAP15692 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VEGFAP15692 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VEGFAP15692 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VEGFAP15692 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VEGFAP15692 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
VEGFAP15692 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VEGFAP15692 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VEGFAP15692 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
VEGFAP15692 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
VEGFAP15692 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VEGFAP15692 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VEGFAP15692 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
VEGFAP15692 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
VEGFAP15692 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VEGFAP15692 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
VEGFAP15692 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
VEGFAP15692 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
VEGFAP15692 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
VEGFAP15692 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
VEGFAP15692 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
VEGFAP15692 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
VEGFAP15692 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
VEGFAP15692 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
VEGFAP15692 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VEGFAP15692 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
VEGFAP15692 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VEGFAP15692 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VEGFAP15692 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VEGFAP15692 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VEGFAP15692 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VEGFAP15692 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VEGFAP15692 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VEGFAP15692 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VEGFAP15692 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VEGFAP15692 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VEGFAP15692 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VEGFAP15692 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VEGFAP15692 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VEGFAP15692 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VEGFAP15692 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VEGFAP15692 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VEGFAP15692 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VEGFAP15692 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VEGFAP15692 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VEGFAP15692 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VEGFAP15692 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
VEGFAP15692 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
VEGFAP15692 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VEGFAP15692 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
VEGFAP15692 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VEGFAP15692 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VEGFAP15692 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VEGFAP15692 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VEGFAP15692 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VEGFAP15692 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VEGFAP15692 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VEGFAP15692 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VEGFAP15692 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VEGFAP15692 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VEGFAP15692 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VEGFAP15692 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VEGFAP15692 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VEGFAP15692 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VEGFAP15692 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
VEGFAP15692 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VEGFAP15692 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VEGFAP15692 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VEGFAP15692 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VEGFAP15692 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VEGFAP15692 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
VEGFAP15692 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC27.57■■■□□ 2
VEGFAP15692 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
VEGFAP15692 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VEGFAP15692 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
VEGFAP15692 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms