Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VAV1P15498 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VAV1P15498 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VAV1P15498 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VAV1P15498 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VAV1P15498 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VAV1P15498 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VAV1P15498 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VAV1P15498 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VAV1P15498 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VAV1P15498 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VAV1P15498 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VAV1P15498 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
VAV1P15498 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VAV1P15498 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VAV1P15498 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VAV1P15498 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VAV1P15498 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VAV1P15498 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VAV1P15498 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VAV1P15498 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VAV1P15498 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VAV1P15498 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
VAV1P15498 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VAV1P15498 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VAV1P15498 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VAV1P15498 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VAV1P15498 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VAV1P15498 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VAV1P15498 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VAV1P15498 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VAV1P15498 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VAV1P15498 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VAV1P15498 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VAV1P15498 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VAV1P15498 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VAV1P15498 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VAV1P15498 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VAV1P15498 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VAV1P15498 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VAV1P15498 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VAV1P15498 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VAV1P15498 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VAV1P15498 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VAV1P15498 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VAV1P15498 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VAV1P15498 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
VAV1P15498 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VAV1P15498 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VAV1P15498 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VAV1P15498 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VAV1P15498 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VAV1P15498 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VAV1P15498 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VAV1P15498 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VAV1P15498 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VAV1P15498 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VAV1P15498 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
VAV1P15498 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
VAV1P15498 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VAV1P15498 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
VAV1P15498 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VAV1P15498 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VAV1P15498 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VAV1P15498 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VAV1P15498 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VAV1P15498 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VAV1P15498 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VAV1P15498 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VAV1P15498 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
VAV1P15498 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VAV1P15498 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VAV1P15498 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VAV1P15498 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VAV1P15498 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VAV1P15498 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VAV1P15498 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VAV1P15498 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VAV1P15498 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VAV1P15498 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VAV1P15498 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VAV1P15498 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VAV1P15498 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VAV1P15498 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VAV1P15498 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VAV1P15498 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VAV1P15498 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VAV1P15498 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VAV1P15498 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VAV1P15498 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VAV1P15498 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VAV1P15498 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VAV1P15498 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VAV1P15498 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VAV1P15498 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VAV1P15498 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VAV1P15498 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VAV1P15498 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VAV1P15498 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VAV1P15498 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms