Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRG2P13727 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRG2P13727 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRG2P13727 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRG2P13727 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRG2P13727 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRG2P13727 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRG2P13727 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRG2P13727 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRG2P13727 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRG2P13727 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRG2P13727 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRG2P13727 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRG2P13727 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRG2P13727 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRG2P13727 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PRG2P13727 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRG2P13727 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PRG2P13727 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PRG2P13727 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PRG2P13727 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PRG2P13727 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PRG2P13727 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRG2P13727 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRG2P13727 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRG2P13727 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRG2P13727 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRG2P13727 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRG2P13727 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRG2P13727 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRG2P13727 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRG2P13727 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRG2P13727 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRG2P13727 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRG2P13727 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRG2P13727 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRG2P13727 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRG2P13727 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRG2P13727 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRG2P13727 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRG2P13727 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRG2P13727 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRG2P13727 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRG2P13727 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRG2P13727 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRG2P13727 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRG2P13727 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRG2P13727 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRG2P13727 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRG2P13727 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRG2P13727 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRG2P13727 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRG2P13727 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PRG2P13727 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRG2P13727 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRG2P13727 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRG2P13727 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRG2P13727 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRG2P13727 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRG2P13727 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRG2P13727 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRG2P13727 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRG2P13727 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PRG2P13727 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRG2P13727 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRG2P13727 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRG2P13727 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRG2P13727 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRG2P13727 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRG2P13727 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRG2P13727 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRG2P13727 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRG2P13727 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRG2P13727 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRG2P13727 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRG2P13727 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRG2P13727 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRG2P13727 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRG2P13727 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRG2P13727 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRG2P13727 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRG2P13727 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRG2P13727 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRG2P13727 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRG2P13727 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRG2P13727 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRG2P13727 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRG2P13727 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRG2P13727 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRG2P13727 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRG2P13727 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRG2P13727 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PRG2P13727 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PRG2P13727 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRG2P13727 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRG2P13727 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRG2P13727 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRG2P13727 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRG2P13727 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRG2P13727 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 194.1 ms