Protein–RNA interactions for Protein: P12107

COL11A1, Collagen alpha-1(XI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL11A1P12107 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL11A1P12107 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL11A1P12107 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL11A1P12107 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
COL11A1P12107 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL11A1P12107 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL11A1P12107 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
COL11A1P12107 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL11A1P12107 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL11A1P12107 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL11A1P12107 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL11A1P12107 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL11A1P12107 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL11A1P12107 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL11A1P12107 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL11A1P12107 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL11A1P12107 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL11A1P12107 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
COL11A1P12107 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL11A1P12107 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL11A1P12107 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL11A1P12107 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
COL11A1P12107 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
COL11A1P12107 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
COL11A1P12107 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
COL11A1P12107 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COL11A1P12107 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COL11A1P12107 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
COL11A1P12107 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COL11A1P12107 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
COL11A1P12107 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COL11A1P12107 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COL11A1P12107 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COL11A1P12107 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26■■□□□ 1.75
COL11A1P12107 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL11A1P12107 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL11A1P12107 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL11A1P12107 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL11A1P12107 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL11A1P12107 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL11A1P12107 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL11A1P12107 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
COL11A1P12107 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
COL11A1P12107 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
COL11A1P12107 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
COL11A1P12107 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
COL11A1P12107 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
COL11A1P12107 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL11A1P12107 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL11A1P12107 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL11A1P12107 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL11A1P12107 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL11A1P12107 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL11A1P12107 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL11A1P12107 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL11A1P12107 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL11A1P12107 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL11A1P12107 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL11A1P12107 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL11A1P12107 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL11A1P12107 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL11A1P12107 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL11A1P12107 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL11A1P12107 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL11A1P12107 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
COL11A1P12107 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
COL11A1P12107 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
COL11A1P12107 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
COL11A1P12107 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
COL11A1P12107 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
COL11A1P12107 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
COL11A1P12107 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
COL11A1P12107 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
COL11A1P12107 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COL11A1P12107 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
COL11A1P12107 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
COL11A1P12107 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
COL11A1P12107 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
COL11A1P12107 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
COL11A1P12107 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
COL11A1P12107 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
COL11A1P12107 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COL11A1P12107 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
COL11A1P12107 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
COL11A1P12107 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
COL11A1P12107 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
COL11A1P12107 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
COL11A1P12107 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
COL11A1P12107 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
COL11A1P12107 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
COL11A1P12107 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
COL11A1P12107 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
COL11A1P12107 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
COL11A1P12107 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
COL11A1P12107 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
COL11A1P12107 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
COL11A1P12107 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COL11A1P12107 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COL11A1P12107 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COL11A1P12107 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms