Protein–RNA interactions for Protein: P11802

CDK4, Cyclin-dependent kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK4P11802 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK4P11802 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK4P11802 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK4P11802 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK4P11802 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK4P11802 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK4P11802 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK4P11802 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK4P11802 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK4P11802 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK4P11802 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK4P11802 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK4P11802 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK4P11802 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK4P11802 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK4P11802 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK4P11802 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK4P11802 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK4P11802 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK4P11802 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK4P11802 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK4P11802 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK4P11802 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK4P11802 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK4P11802 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK4P11802 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK4P11802 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK4P11802 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK4P11802 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK4P11802 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK4P11802 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK4P11802 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK4P11802 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK4P11802 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK4P11802 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK4P11802 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK4P11802 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK4P11802 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK4P11802 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK4P11802 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK4P11802 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK4P11802 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK4P11802 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK4P11802 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK4P11802 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK4P11802 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK4P11802 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK4P11802 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK4P11802 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK4P11802 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK4P11802 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK4P11802 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK4P11802 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK4P11802 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK4P11802 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK4P11802 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK4P11802 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK4P11802 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK4P11802 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK4P11802 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK4P11802 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK4P11802 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK4P11802 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK4P11802 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK4P11802 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK4P11802 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK4P11802 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK4P11802 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK4P11802 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK4P11802 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK4P11802 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK4P11802 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK4P11802 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK4P11802 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK4P11802 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK4P11802 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK4P11802 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK4P11802 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK4P11802 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK4P11802 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK4P11802 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK4P11802 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK4P11802 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK4P11802 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK4P11802 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK4P11802 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK4P11802 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK4P11802 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK4P11802 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK4P11802 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK4P11802 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK4P11802 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK4P11802 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK4P11802 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK4P11802 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK4P11802 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK4P11802 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK4P11802 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK4P11802 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK4P11802 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms