Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ESRRAP11474 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ESRRAP11474 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ESRRAP11474 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ESRRAP11474 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ESRRAP11474 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ESRRAP11474 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ESRRAP11474 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ESRRAP11474 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ESRRAP11474 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ESRRAP11474 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ESRRAP11474 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ESRRAP11474 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ESRRAP11474 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ESRRAP11474 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ESRRAP11474 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ESRRAP11474 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ESRRAP11474 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ESRRAP11474 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ESRRAP11474 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ESRRAP11474 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ESRRAP11474 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ESRRAP11474 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ESRRAP11474 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ESRRAP11474 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ESRRAP11474 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ESRRAP11474 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ESRRAP11474 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ESRRAP11474 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ESRRAP11474 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ESRRAP11474 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ESRRAP11474 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ESRRAP11474 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ESRRAP11474 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ESRRAP11474 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ESRRAP11474 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ESRRAP11474 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ESRRAP11474 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ESRRAP11474 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ESRRAP11474 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ESRRAP11474 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ESRRAP11474 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ESRRAP11474 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ESRRAP11474 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ESRRAP11474 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ESRRAP11474 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ESRRAP11474 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ESRRAP11474 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ESRRAP11474 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ESRRAP11474 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ESRRAP11474 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ESRRAP11474 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ESRRAP11474 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ESRRAP11474 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ESRRAP11474 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ESRRAP11474 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ESRRAP11474 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ESRRAP11474 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ESRRAP11474 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ESRRAP11474 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ESRRAP11474 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ESRRAP11474 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ESRRAP11474 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ESRRAP11474 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ESRRAP11474 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ESRRAP11474 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ESRRAP11474 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ESRRAP11474 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ESRRAP11474 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ESRRAP11474 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ESRRAP11474 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ESRRAP11474 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ESRRAP11474 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ESRRAP11474 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ESRRAP11474 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ESRRAP11474 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ESRRAP11474 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ESRRAP11474 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ESRRAP11474 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ESRRAP11474 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ESRRAP11474 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ESRRAP11474 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ESRRAP11474 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ESRRAP11474 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ESRRAP11474 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ESRRAP11474 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ESRRAP11474 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ESRRAP11474 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ESRRAP11474 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ESRRAP11474 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ESRRAP11474 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ESRRAP11474 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ESRRAP11474 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ESRRAP11474 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ESRRAP11474 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ESRRAP11474 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ESRRAP11474 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ESRRAP11474 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ESRRAP11474 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ESRRAP11474 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms