Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNB1P11230 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNB1P11230 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNB1P11230 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNB1P11230 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNB1P11230 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNB1P11230 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNB1P11230 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNB1P11230 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNB1P11230 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNB1P11230 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNB1P11230 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNB1P11230 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNB1P11230 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNB1P11230 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNB1P11230 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNB1P11230 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNB1P11230 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNB1P11230 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNB1P11230 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRNB1P11230 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRNB1P11230 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRNB1P11230 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRNB1P11230 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRNB1P11230 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNB1P11230 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNB1P11230 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNB1P11230 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNB1P11230 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNB1P11230 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNB1P11230 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNB1P11230 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNB1P11230 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNB1P11230 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNB1P11230 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNB1P11230 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNB1P11230 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNB1P11230 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNB1P11230 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNB1P11230 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNB1P11230 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHRNB1P11230 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHRNB1P11230 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CHRNB1P11230 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNB1P11230 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNB1P11230 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNB1P11230 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNB1P11230 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNB1P11230 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNB1P11230 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNB1P11230 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNB1P11230 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNB1P11230 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNB1P11230 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNB1P11230 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNB1P11230 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNB1P11230 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNB1P11230 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNB1P11230 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNB1P11230 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNB1P11230 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNB1P11230 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNB1P11230 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNB1P11230 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNB1P11230 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNB1P11230 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNB1P11230 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNB1P11230 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNB1P11230 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNB1P11230 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNB1P11230 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNB1P11230 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNB1P11230 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNB1P11230 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNB1P11230 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNB1P11230 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNB1P11230 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNB1P11230 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNB1P11230 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNB1P11230 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNB1P11230 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNB1P11230 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNB1P11230 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNB1P11230 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNB1P11230 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNB1P11230 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNB1P11230 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNB1P11230 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNB1P11230 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNB1P11230 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNB1P11230 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNB1P11230 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNB1P11230 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNB1P11230 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNB1P11230 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNB1P11230 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNB1P11230 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNB1P11230 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNB1P11230 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNB1P11230 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms