Protein–RNA interactions for Protein: P11055

MYH3, Myosin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH3P11055 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MYH3P11055 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MYH3P11055 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MYH3P11055 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MYH3P11055 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MYH3P11055 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MYH3P11055 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
MYH3P11055 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
MYH3P11055 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
MYH3P11055 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
MYH3P11055 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
MYH3P11055 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MYH3P11055 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MYH3P11055 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MYH3P11055 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MYH3P11055 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MYH3P11055 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MYH3P11055 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
MYH3P11055 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
MYH3P11055 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MYH3P11055 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MYH3P11055 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MYH3P11055 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MYH3P11055 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MYH3P11055 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MYH3P11055 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MYH3P11055 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MYH3P11055 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
MYH3P11055 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MYH3P11055 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MYH3P11055 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MYH3P11055 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MYH3P11055 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MYH3P11055 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MYH3P11055 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MYH3P11055 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MYH3P11055 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
MYH3P11055 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MYH3P11055 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MYH3P11055 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MYH3P11055 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MYH3P11055 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MYH3P11055 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MYH3P11055 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
MYH3P11055 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYH3P11055 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYH3P11055 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYH3P11055 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYH3P11055 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
MYH3P11055 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MYH3P11055 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MYH3P11055 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MYH3P11055 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MYH3P11055 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MYH3P11055 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MYH3P11055 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MYH3P11055 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
MYH3P11055 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MYH3P11055 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MYH3P11055 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MYH3P11055 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MYH3P11055 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MYH3P11055 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MYH3P11055 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MYH3P11055 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
MYH3P11055 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MYH3P11055 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MYH3P11055 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MYH3P11055 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MYH3P11055 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MYH3P11055 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MYH3P11055 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MYH3P11055 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MYH3P11055 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MYH3P11055 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
MYH3P11055 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MYH3P11055 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MYH3P11055 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MYH3P11055 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MYH3P11055 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MYH3P11055 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MYH3P11055 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MYH3P11055 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MYH3P11055 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MYH3P11055 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
MYH3P11055 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MYH3P11055 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MYH3P11055 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MYH3P11055 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MYH3P11055 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MYH3P11055 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
MYH3P11055 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MYH3P11055 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MYH3P11055 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MYH3P11055 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MYH3P11055 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MYH3P11055 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MYH3P11055 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MYH3P11055 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MYH3P11055 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms