Protein–RNA interactions for Protein: P10747

CD28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD28P10747 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CD28P10747 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CD28P10747 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CD28P10747 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CD28P10747 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CD28P10747 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CD28P10747 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CD28P10747 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CD28P10747 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CD28P10747 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CD28P10747 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CD28P10747 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CD28P10747 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CD28P10747 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CD28P10747 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CD28P10747 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CD28P10747 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CD28P10747 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CD28P10747 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CD28P10747 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CD28P10747 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CD28P10747 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CD28P10747 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CD28P10747 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CD28P10747 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CD28P10747 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CD28P10747 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CD28P10747 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CD28P10747 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CD28P10747 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CD28P10747 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CD28P10747 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CD28P10747 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CD28P10747 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CD28P10747 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CD28P10747 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CD28P10747 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CD28P10747 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CD28P10747 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CD28P10747 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CD28P10747 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD28P10747 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD28P10747 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD28P10747 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD28P10747 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD28P10747 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD28P10747 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD28P10747 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD28P10747 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CD28P10747 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD28P10747 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD28P10747 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CD28P10747 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD28P10747 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD28P10747 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD28P10747 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD28P10747 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD28P10747 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD28P10747 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD28P10747 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD28P10747 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD28P10747 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD28P10747 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD28P10747 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD28P10747 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD28P10747 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD28P10747 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD28P10747 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD28P10747 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD28P10747 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD28P10747 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD28P10747 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD28P10747 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD28P10747 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD28P10747 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD28P10747 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD28P10747 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD28P10747 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD28P10747 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD28P10747 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD28P10747 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD28P10747 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD28P10747 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD28P10747 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD28P10747 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CD28P10747 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CD28P10747 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD28P10747 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CD28P10747 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CD28P10747 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CD28P10747 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CD28P10747 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CD28P10747 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CD28P10747 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CD28P10747 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CD28P10747 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CD28P10747 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CD28P10747 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD28P10747 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD28P10747 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms