Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NR2F1P10589 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NR2F1P10589 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NR2F1P10589 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NR2F1P10589 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NR2F1P10589 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NR2F1P10589 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NR2F1P10589 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NR2F1P10589 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NR2F1P10589 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NR2F1P10589 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NR2F1P10589 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NR2F1P10589 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NR2F1P10589 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NR2F1P10589 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NR2F1P10589 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NR2F1P10589 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NR2F1P10589 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NR2F1P10589 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NR2F1P10589 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NR2F1P10589 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NR2F1P10589 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NR2F1P10589 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NR2F1P10589 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NR2F1P10589 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NR2F1P10589 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NR2F1P10589 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NR2F1P10589 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NR2F1P10589 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NR2F1P10589 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NR2F1P10589 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NR2F1P10589 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NR2F1P10589 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NR2F1P10589 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NR2F1P10589 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NR2F1P10589 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NR2F1P10589 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NR2F1P10589 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NR2F1P10589 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NR2F1P10589 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NR2F1P10589 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NR2F1P10589 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NR2F1P10589 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NR2F1P10589 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NR2F1P10589 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NR2F1P10589 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NR2F1P10589 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NR2F1P10589 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NR2F1P10589 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NR2F1P10589 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NR2F1P10589 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NR2F1P10589 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NR2F1P10589 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NR2F1P10589 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NR2F1P10589 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NR2F1P10589 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NR2F1P10589 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NR2F1P10589 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NR2F1P10589 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NR2F1P10589 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NR2F1P10589 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NR2F1P10589 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NR2F1P10589 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NR2F1P10589 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NR2F1P10589 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NR2F1P10589 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NR2F1P10589 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NR2F1P10589 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NR2F1P10589 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NR2F1P10589 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NR2F1P10589 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NR2F1P10589 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NR2F1P10589 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NR2F1P10589 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NR2F1P10589 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NR2F1P10589 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NR2F1P10589 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NR2F1P10589 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NR2F1P10589 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms