Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
TMEM225BP0DP42 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
TMEM225BP0DP42 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
TMEM225BP0DP42 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM225BP0DP42 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM225BP0DP42 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM225BP0DP42 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM225BP0DP42 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM225BP0DP42 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM225BP0DP42 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM225BP0DP42 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM225BP0DP42 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM225BP0DP42 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM225BP0DP42 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM225BP0DP42 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM225BP0DP42 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM225BP0DP42 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM225BP0DP42 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM225BP0DP42 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM225BP0DP42 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM225BP0DP42 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM225BP0DP42 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM225BP0DP42 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM225BP0DP42 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM225BP0DP42 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM225BP0DP42 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM225BP0DP42 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM225BP0DP42 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM225BP0DP42 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM225BP0DP42 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM225BP0DP42 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM225BP0DP42 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM225BP0DP42 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM225BP0DP42 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM225BP0DP42 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM225BP0DP42 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM225BP0DP42 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM225BP0DP42 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM225BP0DP42 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM225BP0DP42 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM225BP0DP42 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM225BP0DP42 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM225BP0DP42 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM225BP0DP42 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM225BP0DP42 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM225BP0DP42 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM225BP0DP42 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM225BP0DP42 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM225BP0DP42 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM225BP0DP42 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM225BP0DP42 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM225BP0DP42 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM225BP0DP42 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM225BP0DP42 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM225BP0DP42 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM225BP0DP42 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM225BP0DP42 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM225BP0DP42 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM225BP0DP42 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM225BP0DP42 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM225BP0DP42 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM225BP0DP42 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM225BP0DP42 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM225BP0DP42 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM225BP0DP42 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM225BP0DP42 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM225BP0DP42 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM225BP0DP42 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM225BP0DP42 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM225BP0DP42 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM225BP0DP42 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM225BP0DP42 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TMEM225BP0DP42 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TMEM225BP0DP42 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TMEM225BP0DP42 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TMEM225BP0DP42 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TMEM225BP0DP42 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms