Protein–RNA interactions for Protein: P09874

PARP1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP1P09874 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PARP1P09874 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PARP1P09874 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PARP1P09874 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PARP1P09874 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PARP1P09874 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PARP1P09874 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PARP1P09874 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PARP1P09874 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PARP1P09874 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PARP1P09874 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PARP1P09874 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PARP1P09874 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PARP1P09874 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PARP1P09874 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PARP1P09874 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PARP1P09874 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PARP1P09874 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PARP1P09874 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PARP1P09874 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PARP1P09874 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PARP1P09874 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PARP1P09874 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PARP1P09874 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PARP1P09874 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PARP1P09874 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PARP1P09874 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PARP1P09874 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PARP1P09874 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PARP1P09874 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PARP1P09874 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PARP1P09874 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PARP1P09874 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PARP1P09874 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PARP1P09874 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PARP1P09874 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PARP1P09874 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PARP1P09874 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PARP1P09874 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PARP1P09874 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PARP1P09874 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PARP1P09874 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PARP1P09874 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PARP1P09874 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PARP1P09874 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PARP1P09874 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PARP1P09874 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PARP1P09874 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PARP1P09874 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PARP1P09874 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PARP1P09874 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PARP1P09874 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PARP1P09874 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PARP1P09874 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PARP1P09874 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PARP1P09874 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PARP1P09874 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PARP1P09874 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PARP1P09874 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PARP1P09874 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PARP1P09874 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PARP1P09874 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PARP1P09874 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PARP1P09874 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PARP1P09874 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PARP1P09874 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PARP1P09874 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PARP1P09874 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PARP1P09874 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PARP1P09874 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PARP1P09874 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PARP1P09874 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PARP1P09874 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PARP1P09874 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PARP1P09874 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PARP1P09874 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PARP1P09874 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PARP1P09874 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PARP1P09874 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PARP1P09874 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PARP1P09874 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PARP1P09874 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PARP1P09874 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PARP1P09874 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PARP1P09874 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PARP1P09874 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PARP1P09874 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PARP1P09874 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PARP1P09874 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PARP1P09874 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PARP1P09874 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PARP1P09874 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PARP1P09874 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PARP1P09874 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PARP1P09874 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PARP1P09874 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PARP1P09874 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PARP1P09874 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PARP1P09874 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PARP1P09874 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms