Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VIL1P09327 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VIL1P09327 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
VIL1P09327 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
VIL1P09327 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
VIL1P09327 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
VIL1P09327 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
VIL1P09327 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
VIL1P09327 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
VIL1P09327 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
VIL1P09327 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
VIL1P09327 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VIL1P09327 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VIL1P09327 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
VIL1P09327 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VIL1P09327 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VIL1P09327 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VIL1P09327 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VIL1P09327 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
VIL1P09327 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
VIL1P09327 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VIL1P09327 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VIL1P09327 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VIL1P09327 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
VIL1P09327 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VIL1P09327 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
VIL1P09327 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VIL1P09327 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
VIL1P09327 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VIL1P09327 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VIL1P09327 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
VIL1P09327 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
VIL1P09327 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
VIL1P09327 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
VIL1P09327 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VIL1P09327 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VIL1P09327 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VIL1P09327 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VIL1P09327 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
VIL1P09327 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
VIL1P09327 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
VIL1P09327 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VIL1P09327 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
VIL1P09327 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VIL1P09327 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VIL1P09327 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VIL1P09327 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
VIL1P09327 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VIL1P09327 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VIL1P09327 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
VIL1P09327 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
VIL1P09327 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VIL1P09327 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VIL1P09327 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
VIL1P09327 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
VIL1P09327 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VIL1P09327 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
VIL1P09327 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VIL1P09327 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VIL1P09327 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VIL1P09327 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
VIL1P09327 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
VIL1P09327 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
VIL1P09327 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VIL1P09327 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VIL1P09327 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VIL1P09327 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
VIL1P09327 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VIL1P09327 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VIL1P09327 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VIL1P09327 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VIL1P09327 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VIL1P09327 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VIL1P09327 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VIL1P09327 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VIL1P09327 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
VIL1P09327 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VIL1P09327 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VIL1P09327 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VIL1P09327 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VIL1P09327 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VIL1P09327 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VIL1P09327 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
VIL1P09327 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VIL1P09327 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VIL1P09327 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VIL1P09327 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VIL1P09327 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
VIL1P09327 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VIL1P09327 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VIL1P09327 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VIL1P09327 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VIL1P09327 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VIL1P09327 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VIL1P09327 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
VIL1P09327 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
VIL1P09327 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
VIL1P09327 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
VIL1P09327 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
VIL1P09327 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms