Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYBBP04839 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYBBP04839 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYBBP04839 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYBBP04839 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYBBP04839 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYBBP04839 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYBBP04839 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYBBP04839 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYBBP04839 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYBBP04839 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYBBP04839 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYBBP04839 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYBBP04839 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYBBP04839 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYBBP04839 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYBBP04839 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYBBP04839 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYBBP04839 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYBBP04839 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYBBP04839 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYBBP04839 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYBBP04839 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYBBP04839 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYBBP04839 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYBBP04839 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYBBP04839 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYBBP04839 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYBBP04839 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYBBP04839 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYBBP04839 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYBBP04839 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYBBP04839 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYBBP04839 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CYBBP04839 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYBBP04839 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYBBP04839 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CYBBP04839 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYBBP04839 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYBBP04839 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYBBP04839 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYBBP04839 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYBBP04839 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYBBP04839 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYBBP04839 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYBBP04839 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYBBP04839 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYBBP04839 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYBBP04839 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYBBP04839 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CYBBP04839 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYBBP04839 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYBBP04839 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYBBP04839 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CYBBP04839 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CYBBP04839 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CYBBP04839 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CYBBP04839 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYBBP04839 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYBBP04839 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYBBP04839 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYBBP04839 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYBBP04839 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYBBP04839 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CYBBP04839 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYBBP04839 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYBBP04839 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYBBP04839 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYBBP04839 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYBBP04839 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYBBP04839 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYBBP04839 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYBBP04839 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYBBP04839 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYBBP04839 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYBBP04839 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYBBP04839 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYBBP04839 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYBBP04839 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYBBP04839 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYBBP04839 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYBBP04839 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYBBP04839 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYBBP04839 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYBBP04839 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYBBP04839 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CYBBP04839 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYBBP04839 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYBBP04839 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYBBP04839 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYBBP04839 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYBBP04839 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYBBP04839 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYBBP04839 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYBBP04839 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYBBP04839 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYBBP04839 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYBBP04839 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYBBP04839 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYBBP04839 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms