Protein–RNA interactions for Protein: O95977

S1PR4, Sphingosine 1-phosphate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S1PR4O95977 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
S1PR4O95977 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
S1PR4O95977 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
S1PR4O95977 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
S1PR4O95977 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
S1PR4O95977 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
S1PR4O95977 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
S1PR4O95977 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
S1PR4O95977 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
S1PR4O95977 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
S1PR4O95977 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
S1PR4O95977 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
S1PR4O95977 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
S1PR4O95977 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
S1PR4O95977 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
S1PR4O95977 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
S1PR4O95977 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
S1PR4O95977 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
S1PR4O95977 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
S1PR4O95977 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
S1PR4O95977 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
S1PR4O95977 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
S1PR4O95977 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
S1PR4O95977 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
S1PR4O95977 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
S1PR4O95977 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
S1PR4O95977 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
S1PR4O95977 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
S1PR4O95977 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
S1PR4O95977 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
S1PR4O95977 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
S1PR4O95977 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
S1PR4O95977 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
S1PR4O95977 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
S1PR4O95977 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
S1PR4O95977 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
S1PR4O95977 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
S1PR4O95977 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
S1PR4O95977 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
S1PR4O95977 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
S1PR4O95977 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
S1PR4O95977 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
S1PR4O95977 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
S1PR4O95977 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
S1PR4O95977 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
S1PR4O95977 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
S1PR4O95977 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
S1PR4O95977 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
S1PR4O95977 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
S1PR4O95977 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
S1PR4O95977 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
S1PR4O95977 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
S1PR4O95977 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
S1PR4O95977 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
S1PR4O95977 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
S1PR4O95977 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
S1PR4O95977 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
S1PR4O95977 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
S1PR4O95977 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
S1PR4O95977 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
S1PR4O95977 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
S1PR4O95977 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
S1PR4O95977 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
S1PR4O95977 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
S1PR4O95977 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
S1PR4O95977 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
S1PR4O95977 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
S1PR4O95977 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
S1PR4O95977 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
S1PR4O95977 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
S1PR4O95977 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
S1PR4O95977 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
S1PR4O95977 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
S1PR4O95977 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
S1PR4O95977 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
S1PR4O95977 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
S1PR4O95977 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
S1PR4O95977 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
S1PR4O95977 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
S1PR4O95977 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
S1PR4O95977 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
S1PR4O95977 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
S1PR4O95977 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
S1PR4O95977 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
S1PR4O95977 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
S1PR4O95977 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
S1PR4O95977 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
S1PR4O95977 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
S1PR4O95977 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
S1PR4O95977 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
S1PR4O95977 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
S1PR4O95977 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
S1PR4O95977 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
S1PR4O95977 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
S1PR4O95977 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
S1PR4O95977 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
S1PR4O95977 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
S1PR4O95977 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
S1PR4O95977 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
S1PR4O95977 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms