Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POP4O95707 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POP4O95707 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
POP4O95707 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POP4O95707 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POP4O95707 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POP4O95707 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POP4O95707 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POP4O95707 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POP4O95707 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POP4O95707 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POP4O95707 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
POP4O95707 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POP4O95707 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POP4O95707 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POP4O95707 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POP4O95707 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POP4O95707 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POP4O95707 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POP4O95707 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
POP4O95707 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POP4O95707 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POP4O95707 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POP4O95707 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POP4O95707 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POP4O95707 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
POP4O95707 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POP4O95707 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POP4O95707 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POP4O95707 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POP4O95707 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POP4O95707 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POP4O95707 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POP4O95707 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POP4O95707 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POP4O95707 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POP4O95707 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POP4O95707 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POP4O95707 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POP4O95707 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POP4O95707 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POP4O95707 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POP4O95707 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POP4O95707 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POP4O95707 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
POP4O95707 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POP4O95707 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POP4O95707 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POP4O95707 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POP4O95707 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POP4O95707 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POP4O95707 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POP4O95707 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POP4O95707 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POP4O95707 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POP4O95707 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POP4O95707 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POP4O95707 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POP4O95707 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POP4O95707 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POP4O95707 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POP4O95707 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POP4O95707 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POP4O95707 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POP4O95707 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POP4O95707 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POP4O95707 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
POP4O95707 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
POP4O95707 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POP4O95707 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POP4O95707 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POP4O95707 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POP4O95707 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POP4O95707 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POP4O95707 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
POP4O95707 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
POP4O95707 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POP4O95707 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POP4O95707 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
POP4O95707 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POP4O95707 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POP4O95707 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POP4O95707 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POP4O95707 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POP4O95707 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POP4O95707 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POP4O95707 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
POP4O95707 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POP4O95707 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POP4O95707 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POP4O95707 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POP4O95707 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POP4O95707 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POP4O95707 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POP4O95707 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POP4O95707 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POP4O95707 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POP4O95707 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
POP4O95707 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POP4O95707 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms