Protein–RNA interactions for Protein: O94983

CAMTA2, Calmodulin-binding transcription activator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA2O94983 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CAMTA2O94983 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CAMTA2O94983 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CAMTA2O94983 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CAMTA2O94983 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CAMTA2O94983 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CAMTA2O94983 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CAMTA2O94983 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CAMTA2O94983 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CAMTA2O94983 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CAMTA2O94983 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CAMTA2O94983 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CAMTA2O94983 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CAMTA2O94983 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CAMTA2O94983 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CAMTA2O94983 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CAMTA2O94983 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CAMTA2O94983 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CAMTA2O94983 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CAMTA2O94983 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CAMTA2O94983 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CAMTA2O94983 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CAMTA2O94983 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CAMTA2O94983 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CAMTA2O94983 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CAMTA2O94983 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CAMTA2O94983 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CAMTA2O94983 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CAMTA2O94983 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CAMTA2O94983 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CAMTA2O94983 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CAMTA2O94983 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CAMTA2O94983 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CAMTA2O94983 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CAMTA2O94983 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CAMTA2O94983 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CAMTA2O94983 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CAMTA2O94983 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CAMTA2O94983 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CAMTA2O94983 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
CAMTA2O94983 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.16
CAMTA2O94983 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CAMTA2O94983 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CAMTA2O94983 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CAMTA2O94983 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CAMTA2O94983 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CAMTA2O94983 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CAMTA2O94983 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CAMTA2O94983 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CAMTA2O94983 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CAMTA2O94983 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CAMTA2O94983 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CAMTA2O94983 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CAMTA2O94983 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CAMTA2O94983 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CAMTA2O94983 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CAMTA2O94983 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CAMTA2O94983 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CAMTA2O94983 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CAMTA2O94983 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CAMTA2O94983 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CAMTA2O94983 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CAMTA2O94983 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CAMTA2O94983 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CAMTA2O94983 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CAMTA2O94983 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CAMTA2O94983 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CAMTA2O94983 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CAMTA2O94983 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CAMTA2O94983 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CAMTA2O94983 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CAMTA2O94983 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CAMTA2O94983 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CAMTA2O94983 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CAMTA2O94983 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CAMTA2O94983 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CAMTA2O94983 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CAMTA2O94983 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CAMTA2O94983 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CAMTA2O94983 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CAMTA2O94983 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CAMTA2O94983 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CAMTA2O94983 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CAMTA2O94983 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CAMTA2O94983 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CAMTA2O94983 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CAMTA2O94983 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CAMTA2O94983 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CAMTA2O94983 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CAMTA2O94983 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CAMTA2O94983 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CAMTA2O94983 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CAMTA2O94983 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CAMTA2O94983 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CAMTA2O94983 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CAMTA2O94983 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CAMTA2O94983 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CAMTA2O94983 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CAMTA2O94983 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CAMTA2O94983 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.1 ms