Protein–RNA interactions for Protein: O94876

TMCC1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC1O94876 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMCC1O94876 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMCC1O94876 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMCC1O94876 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMCC1O94876 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMCC1O94876 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMCC1O94876 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMCC1O94876 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMCC1O94876 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMCC1O94876 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMCC1O94876 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMCC1O94876 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TMCC1O94876 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMCC1O94876 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMCC1O94876 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMCC1O94876 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMCC1O94876 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMCC1O94876 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMCC1O94876 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMCC1O94876 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMCC1O94876 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMCC1O94876 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMCC1O94876 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMCC1O94876 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMCC1O94876 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMCC1O94876 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMCC1O94876 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMCC1O94876 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMCC1O94876 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TMCC1O94876 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMCC1O94876 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMCC1O94876 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMCC1O94876 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMCC1O94876 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMCC1O94876 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMCC1O94876 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMCC1O94876 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMCC1O94876 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMCC1O94876 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMCC1O94876 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMCC1O94876 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TMCC1O94876 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMCC1O94876 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMCC1O94876 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMCC1O94876 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMCC1O94876 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMCC1O94876 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMCC1O94876 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMCC1O94876 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMCC1O94876 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMCC1O94876 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMCC1O94876 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMCC1O94876 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMCC1O94876 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMCC1O94876 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TMCC1O94876 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMCC1O94876 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMCC1O94876 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMCC1O94876 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMCC1O94876 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TMCC1O94876 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMCC1O94876 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMCC1O94876 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMCC1O94876 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMCC1O94876 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMCC1O94876 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMCC1O94876 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMCC1O94876 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMCC1O94876 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMCC1O94876 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMCC1O94876 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMCC1O94876 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMCC1O94876 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMCC1O94876 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMCC1O94876 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMCC1O94876 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMCC1O94876 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMCC1O94876 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMCC1O94876 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMCC1O94876 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMCC1O94876 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMCC1O94876 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMCC1O94876 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMCC1O94876 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMCC1O94876 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMCC1O94876 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMCC1O94876 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMCC1O94876 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TMCC1O94876 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMCC1O94876 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMCC1O94876 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMCC1O94876 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMCC1O94876 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMCC1O94876 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMCC1O94876 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMCC1O94876 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TMCC1O94876 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMCC1O94876 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMCC1O94876 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMCC1O94876 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms