Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCATO75600 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCATO75600 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCATO75600 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCATO75600 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCATO75600 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCATO75600 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCATO75600 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCATO75600 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GCATO75600 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GCATO75600 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GCATO75600 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GCATO75600 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GCATO75600 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GCATO75600 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCATO75600 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCATO75600 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCATO75600 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCATO75600 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCATO75600 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCATO75600 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCATO75600 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCATO75600 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCATO75600 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCATO75600 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCATO75600 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCATO75600 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCATO75600 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCATO75600 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCATO75600 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCATO75600 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GCATO75600 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GCATO75600 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCATO75600 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCATO75600 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GCATO75600 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCATO75600 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCATO75600 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCATO75600 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCATO75600 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GCATO75600 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCATO75600 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCATO75600 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCATO75600 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCATO75600 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCATO75600 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCATO75600 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCATO75600 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCATO75600 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCATO75600 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCATO75600 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCATO75600 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCATO75600 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCATO75600 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCATO75600 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCATO75600 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCATO75600 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCATO75600 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCATO75600 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GCATO75600 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCATO75600 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCATO75600 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCATO75600 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCATO75600 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCATO75600 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GCATO75600 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GCATO75600 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GCATO75600 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GCATO75600 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GCATO75600 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GCATO75600 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GCATO75600 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GCATO75600 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GCATO75600 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GCATO75600 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GCATO75600 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GCATO75600 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GCATO75600 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GCATO75600 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GCATO75600 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GCATO75600 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GCATO75600 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GCATO75600 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GCATO75600 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GCATO75600 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GCATO75600 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GCATO75600 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GCATO75600 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GCATO75600 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GCATO75600 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GCATO75600 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCATO75600 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCATO75600 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCATO75600 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCATO75600 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCATO75600 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCATO75600 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCATO75600 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCATO75600 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCATO75600 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms