Protein–RNA interactions for Protein: O75487

GPC4, Glypican-4, humanhuman

Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC4O75487 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPC4O75487 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC4O75487 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC4O75487 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC4O75487 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC4O75487 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC4O75487 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC4O75487 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC4O75487 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC4O75487 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC4O75487 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC4O75487 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC4O75487 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC4O75487 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC4O75487 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPC4O75487 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPC4O75487 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPC4O75487 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPC4O75487 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPC4O75487 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPC4O75487 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GPC4O75487 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPC4O75487 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPC4O75487 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPC4O75487 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPC4O75487 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPC4O75487 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPC4O75487 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPC4O75487 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPC4O75487 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPC4O75487 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPC4O75487 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPC4O75487 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPC4O75487 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPC4O75487 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPC4O75487 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPC4O75487 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPC4O75487 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPC4O75487 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPC4O75487 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPC4O75487 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPC4O75487 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPC4O75487 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPC4O75487 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GPC4O75487 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GPC4O75487 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPC4O75487 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPC4O75487 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPC4O75487 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPC4O75487 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPC4O75487 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPC4O75487 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPC4O75487 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GPC4O75487 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPC4O75487 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPC4O75487 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPC4O75487 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPC4O75487 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPC4O75487 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPC4O75487 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC4O75487 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC4O75487 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC4O75487 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC4O75487 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC4O75487 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC4O75487 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC4O75487 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC4O75487 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC4O75487 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC4O75487 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC4O75487 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC4O75487 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC4O75487 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC4O75487 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC4O75487 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC4O75487 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPC4O75487 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPC4O75487 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPC4O75487 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPC4O75487 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPC4O75487 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPC4O75487 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPC4O75487 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPC4O75487 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPC4O75487 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPC4O75487 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPC4O75487 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GPC4O75487 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPC4O75487 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPC4O75487 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPC4O75487 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GPC4O75487 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GPC4O75487 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPC4O75487 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPC4O75487 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPC4O75487 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GPC4O75487 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPC4O75487 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPC4O75487 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPC4O75487 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms