Protein–RNA interactions for Protein: O60810

PRAMEF4, PRAME family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF4O60810 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF4O60810 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF4O60810 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF4O60810 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF4O60810 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF4O60810 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF4O60810 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF4O60810 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF4O60810 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF4O60810 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF4O60810 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF4O60810 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF4O60810 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF4O60810 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF4O60810 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF4O60810 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF4O60810 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF4O60810 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF4O60810 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF4O60810 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF4O60810 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF4O60810 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF4O60810 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF4O60810 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF4O60810 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF4O60810 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF4O60810 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF4O60810 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF4O60810 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF4O60810 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF4O60810 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF4O60810 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF4O60810 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF4O60810 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF4O60810 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF4O60810 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF4O60810 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF4O60810 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF4O60810 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF4O60810 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF4O60810 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF4O60810 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF4O60810 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF4O60810 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF4O60810 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF4O60810 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF4O60810 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF4O60810 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF4O60810 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF4O60810 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF4O60810 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF4O60810 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRAMEF4O60810 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRAMEF4O60810 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRAMEF4O60810 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRAMEF4O60810 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRAMEF4O60810 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRAMEF4O60810 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PRAMEF4O60810 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF4O60810 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF4O60810 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF4O60810 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF4O60810 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF4O60810 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF4O60810 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF4O60810 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF4O60810 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF4O60810 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF4O60810 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF4O60810 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF4O60810 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF4O60810 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF4O60810 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRAMEF4O60810 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRAMEF4O60810 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRAMEF4O60810 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRAMEF4O60810 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRAMEF4O60810 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRAMEF4O60810 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRAMEF4O60810 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF4O60810 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF4O60810 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF4O60810 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF4O60810 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF4O60810 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF4O60810 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF4O60810 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRAMEF4O60810 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRAMEF4O60810 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRAMEF4O60810 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRAMEF4O60810 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRAMEF4O60810 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRAMEF4O60810 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PRAMEF4O60810 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRAMEF4O60810 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRAMEF4O60810 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRAMEF4O60810 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRAMEF4O60810 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRAMEF4O60810 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRAMEF4O60810 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms