Protein–RNA interactions for Protein: O60524

NEMF, Nuclear export mediator factor NEMF, humanhuman

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMFO60524 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEMFO60524 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEMFO60524 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEMFO60524 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEMFO60524 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEMFO60524 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEMFO60524 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEMFO60524 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEMFO60524 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEMFO60524 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEMFO60524 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEMFO60524 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEMFO60524 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NEMFO60524 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEMFO60524 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEMFO60524 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEMFO60524 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEMFO60524 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEMFO60524 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEMFO60524 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEMFO60524 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEMFO60524 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NEMFO60524 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NEMFO60524 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NEMFO60524 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEMFO60524 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NEMFO60524 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NEMFO60524 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NEMFO60524 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NEMFO60524 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEMFO60524 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEMFO60524 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEMFO60524 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEMFO60524 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEMFO60524 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEMFO60524 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEMFO60524 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEMFO60524 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEMFO60524 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEMFO60524 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEMFO60524 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEMFO60524 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEMFO60524 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEMFO60524 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEMFO60524 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NEMFO60524 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEMFO60524 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEMFO60524 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEMFO60524 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEMFO60524 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEMFO60524 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEMFO60524 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEMFO60524 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEMFO60524 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEMFO60524 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEMFO60524 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEMFO60524 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEMFO60524 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEMFO60524 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEMFO60524 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEMFO60524 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEMFO60524 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEMFO60524 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEMFO60524 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEMFO60524 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEMFO60524 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEMFO60524 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEMFO60524 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEMFO60524 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEMFO60524 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEMFO60524 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEMFO60524 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEMFO60524 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEMFO60524 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEMFO60524 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEMFO60524 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEMFO60524 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEMFO60524 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEMFO60524 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEMFO60524 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NEMFO60524 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEMFO60524 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEMFO60524 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEMFO60524 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEMFO60524 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEMFO60524 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEMFO60524 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEMFO60524 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEMFO60524 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEMFO60524 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEMFO60524 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEMFO60524 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEMFO60524 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEMFO60524 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEMFO60524 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEMFO60524 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEMFO60524 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEMFO60524 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEMFO60524 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEMFO60524 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms