Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP104O60308 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP104O60308 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP104O60308 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CEP104O60308 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CEP104O60308 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CEP104O60308 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CEP104O60308 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CEP104O60308 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CEP104O60308 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CEP104O60308 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CEP104O60308 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CEP104O60308 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CEP104O60308 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CEP104O60308 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CEP104O60308 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CEP104O60308 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CEP104O60308 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CEP104O60308 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CEP104O60308 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CEP104O60308 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CEP104O60308 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CEP104O60308 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CEP104O60308 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CEP104O60308 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CEP104O60308 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CEP104O60308 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CEP104O60308 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CEP104O60308 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CEP104O60308 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CEP104O60308 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CEP104O60308 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CEP104O60308 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CEP104O60308 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CEP104O60308 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CEP104O60308 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CEP104O60308 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CEP104O60308 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CEP104O60308 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CEP104O60308 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CEP104O60308 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CEP104O60308 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CEP104O60308 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEP104O60308 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEP104O60308 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEP104O60308 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEP104O60308 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEP104O60308 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEP104O60308 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEP104O60308 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEP104O60308 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEP104O60308 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEP104O60308 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEP104O60308 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEP104O60308 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEP104O60308 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEP104O60308 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEP104O60308 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CEP104O60308 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CEP104O60308 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CEP104O60308 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CEP104O60308 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CEP104O60308 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CEP104O60308 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CEP104O60308 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CEP104O60308 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CEP104O60308 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CEP104O60308 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CEP104O60308 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CEP104O60308 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CEP104O60308 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CEP104O60308 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CEP104O60308 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CEP104O60308 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEP104O60308 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEP104O60308 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEP104O60308 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEP104O60308 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEP104O60308 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEP104O60308 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEP104O60308 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEP104O60308 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEP104O60308 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEP104O60308 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEP104O60308 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEP104O60308 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEP104O60308 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEP104O60308 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CEP104O60308 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CEP104O60308 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CEP104O60308 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CEP104O60308 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CEP104O60308 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CEP104O60308 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CEP104O60308 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CEP104O60308 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CEP104O60308 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CEP104O60308 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CEP104O60308 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CEP104O60308 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms