Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMARCA5O60264 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMARCA5O60264 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMARCA5O60264 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMARCA5O60264 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMARCA5O60264 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMARCA5O60264 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMARCA5O60264 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMARCA5O60264 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMARCA5O60264 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMARCA5O60264 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMARCA5O60264 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
SMARCA5O60264 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SMARCA5O60264 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMARCA5O60264 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMARCA5O60264 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMARCA5O60264 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMARCA5O60264 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMARCA5O60264 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMARCA5O60264 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMARCA5O60264 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMARCA5O60264 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMARCA5O60264 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMARCA5O60264 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMARCA5O60264 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMARCA5O60264 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMARCA5O60264 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMARCA5O60264 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMARCA5O60264 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMARCA5O60264 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMARCA5O60264 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMARCA5O60264 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SMARCA5O60264 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMARCA5O60264 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMARCA5O60264 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMARCA5O60264 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMARCA5O60264 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMARCA5O60264 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMARCA5O60264 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMARCA5O60264 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMARCA5O60264 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMARCA5O60264 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMARCA5O60264 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMARCA5O60264 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SMARCA5O60264 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMARCA5O60264 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMARCA5O60264 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMARCA5O60264 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMARCA5O60264 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMARCA5O60264 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMARCA5O60264 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMARCA5O60264 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMARCA5O60264 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMARCA5O60264 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMARCA5O60264 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMARCA5O60264 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMARCA5O60264 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMARCA5O60264 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMARCA5O60264 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCA5O60264 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCA5O60264 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCA5O60264 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCA5O60264 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCA5O60264 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCA5O60264 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCA5O60264 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMARCA5O60264 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMARCA5O60264 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMARCA5O60264 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMARCA5O60264 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMARCA5O60264 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMARCA5O60264 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SMARCA5O60264 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SMARCA5O60264 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMARCA5O60264 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SMARCA5O60264 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SMARCA5O60264 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMARCA5O60264 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMARCA5O60264 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMARCA5O60264 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMARCA5O60264 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMARCA5O60264 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMARCA5O60264 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMARCA5O60264 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMARCA5O60264 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMARCA5O60264 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMARCA5O60264 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMARCA5O60264 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMARCA5O60264 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMARCA5O60264 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMARCA5O60264 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMARCA5O60264 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMARCA5O60264 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMARCA5O60264 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMARCA5O60264 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMARCA5O60264 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMARCA5O60264 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMARCA5O60264 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMARCA5O60264 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMARCA5O60264 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms