Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SYNGR2O43760 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SYNGR2O43760 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNGR2O43760 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNGR2O43760 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNGR2O43760 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNGR2O43760 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNGR2O43760 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNGR2O43760 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNGR2O43760 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNGR2O43760 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNGR2O43760 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNGR2O43760 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNGR2O43760 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNGR2O43760 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNGR2O43760 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGR2O43760 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGR2O43760 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGR2O43760 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGR2O43760 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGR2O43760 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGR2O43760 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGR2O43760 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGR2O43760 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGR2O43760 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGR2O43760 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGR2O43760 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGR2O43760 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGR2O43760 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGR2O43760 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGR2O43760 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGR2O43760 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGR2O43760 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGR2O43760 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGR2O43760 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGR2O43760 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGR2O43760 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGR2O43760 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGR2O43760 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGR2O43760 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGR2O43760 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGR2O43760 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGR2O43760 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGR2O43760 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGR2O43760 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGR2O43760 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGR2O43760 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNGR2O43760 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNGR2O43760 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNGR2O43760 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNGR2O43760 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNGR2O43760 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNGR2O43760 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNGR2O43760 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNGR2O43760 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNGR2O43760 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNGR2O43760 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNGR2O43760 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNGR2O43760 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNGR2O43760 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNGR2O43760 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNGR2O43760 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNGR2O43760 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNGR2O43760 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNGR2O43760 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNGR2O43760 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNGR2O43760 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNGR2O43760 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNGR2O43760 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNGR2O43760 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNGR2O43760 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNGR2O43760 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNGR2O43760 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNGR2O43760 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNGR2O43760 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNGR2O43760 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNGR2O43760 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNGR2O43760 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNGR2O43760 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNGR2O43760 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNGR2O43760 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNGR2O43760 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNGR2O43760 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNGR2O43760 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNGR2O43760 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNGR2O43760 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNGR2O43760 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNGR2O43760 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNGR2O43760 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNGR2O43760 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNGR2O43760 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNGR2O43760 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNGR2O43760 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNGR2O43760 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNGR2O43760 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNGR2O43760 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNGR2O43760 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms