Protein–RNA interactions for Protein: O43617

TRAPPC3, Trafficking protein particle complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3O43617 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC3O43617 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC3O43617 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC3O43617 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC3O43617 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC3O43617 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC3O43617 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC3O43617 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC3O43617 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC3O43617 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC3O43617 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC3O43617 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC3O43617 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC3O43617 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC3O43617 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC3O43617 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC3O43617 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC3O43617 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC3O43617 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC3O43617 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC3O43617 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC3O43617 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRAPPC3O43617 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAPPC3O43617 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAPPC3O43617 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAPPC3O43617 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAPPC3O43617 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAPPC3O43617 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAPPC3O43617 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAPPC3O43617 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAPPC3O43617 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC3O43617 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC3O43617 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC3O43617 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC3O43617 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC3O43617 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC3O43617 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC3O43617 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC3O43617 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC3O43617 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC3O43617 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC3O43617 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC3O43617 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC3O43617 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC3O43617 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC3O43617 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC3O43617 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC3O43617 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC3O43617 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC3O43617 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC3O43617 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC3O43617 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC3O43617 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC3O43617 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC3O43617 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC3O43617 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC3O43617 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC3O43617 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC3O43617 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC3O43617 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC3O43617 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC3O43617 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC3O43617 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC3O43617 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC3O43617 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC3O43617 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC3O43617 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC3O43617 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC3O43617 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC3O43617 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC3O43617 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
TRAPPC3O43617 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRAPPC3O43617 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRAPPC3O43617 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRAPPC3O43617 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAPPC3O43617 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAPPC3O43617 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC3O43617 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC3O43617 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC3O43617 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC3O43617 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC3O43617 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC3O43617 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC3O43617 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC3O43617 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC3O43617 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC3O43617 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC3O43617 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC3O43617 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC3O43617 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC3O43617 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC3O43617 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC3O43617 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC3O43617 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC3O43617 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC3O43617 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC3O43617 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC3O43617 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC3O43617 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC3O43617 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms