Protein–RNA interactions for Protein: O43567

RNF13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF13O43567 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNF13O43567 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNF13O43567 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNF13O43567 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNF13O43567 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNF13O43567 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNF13O43567 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNF13O43567 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNF13O43567 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNF13O43567 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNF13O43567 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNF13O43567 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNF13O43567 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNF13O43567 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNF13O43567 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNF13O43567 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNF13O43567 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNF13O43567 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RNF13O43567 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNF13O43567 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNF13O43567 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNF13O43567 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RNF13O43567 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF13O43567 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF13O43567 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF13O43567 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF13O43567 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF13O43567 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF13O43567 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF13O43567 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF13O43567 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF13O43567 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF13O43567 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF13O43567 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF13O43567 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF13O43567 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF13O43567 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF13O43567 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF13O43567 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF13O43567 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF13O43567 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF13O43567 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF13O43567 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF13O43567 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF13O43567 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF13O43567 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF13O43567 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF13O43567 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF13O43567 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF13O43567 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF13O43567 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF13O43567 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF13O43567 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF13O43567 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF13O43567 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF13O43567 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF13O43567 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF13O43567 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF13O43567 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF13O43567 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF13O43567 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF13O43567 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF13O43567 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF13O43567 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF13O43567 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF13O43567 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF13O43567 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF13O43567 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF13O43567 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF13O43567 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF13O43567 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF13O43567 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF13O43567 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF13O43567 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF13O43567 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RNF13O43567 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RNF13O43567 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RNF13O43567 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RNF13O43567 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RNF13O43567 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RNF13O43567 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RNF13O43567 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RNF13O43567 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RNF13O43567 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RNF13O43567 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RNF13O43567 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RNF13O43567 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RNF13O43567 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RNF13O43567 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RNF13O43567 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RNF13O43567 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RNF13O43567 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RNF13O43567 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RNF13O43567 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RNF13O43567 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RNF13O43567 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RNF13O43567 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RNF13O43567 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RNF13O43567 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RNF13O43567 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms