Protein–RNA interactions for Protein: O43508

TNFSF12, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 12, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF12O43508 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TNFSF12O43508 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TNFSF12O43508 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TNFSF12O43508 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNFSF12O43508 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNFSF12O43508 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNFSF12O43508 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNFSF12O43508 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNFSF12O43508 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNFSF12O43508 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TNFSF12O43508 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNFSF12O43508 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TNFSF12O43508 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNFSF12O43508 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNFSF12O43508 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNFSF12O43508 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNFSF12O43508 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFSF12O43508 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFSF12O43508 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFSF12O43508 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFSF12O43508 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFSF12O43508 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFSF12O43508 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFSF12O43508 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFSF12O43508 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFSF12O43508 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFSF12O43508 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFSF12O43508 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFSF12O43508 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFSF12O43508 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFSF12O43508 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFSF12O43508 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFSF12O43508 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFSF12O43508 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFSF12O43508 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFSF12O43508 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFSF12O43508 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFSF12O43508 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFSF12O43508 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFSF12O43508 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFSF12O43508 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFSF12O43508 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNFSF12O43508 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNFSF12O43508 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TNFSF12O43508 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNFSF12O43508 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNFSF12O43508 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNFSF12O43508 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNFSF12O43508 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNFSF12O43508 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNFSF12O43508 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TNFSF12O43508 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNFSF12O43508 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNFSF12O43508 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNFSF12O43508 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNFSF12O43508 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNFSF12O43508 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNFSF12O43508 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNFSF12O43508 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNFSF12O43508 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNFSF12O43508 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
TNFSF12O43508 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
TNFSF12O43508 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
TNFSF12O43508 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNFSF12O43508 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNFSF12O43508 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNFSF12O43508 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNFSF12O43508 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNFSF12O43508 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNFSF12O43508 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNFSF12O43508 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNFSF12O43508 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNFSF12O43508 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNFSF12O43508 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNFSF12O43508 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNFSF12O43508 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TNFSF12O43508 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TNFSF12O43508 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TNFSF12O43508 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TNFSF12O43508 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TNFSF12O43508 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TNFSF12O43508 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TNFSF12O43508 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TNFSF12O43508 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TNFSF12O43508 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TNFSF12O43508 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TNFSF12O43508 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TNFSF12O43508 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TNFSF12O43508 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TNFSF12O43508 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TNFSF12O43508 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TNFSF12O43508 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TNFSF12O43508 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TNFSF12O43508 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TNFSF12O43508 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TNFSF12O43508 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TNFSF12O43508 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TNFSF12O43508 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TNFSF12O43508 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TNFSF12O43508 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms