Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR1CO15160 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR1CO15160 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR1CO15160 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR1CO15160 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR1CO15160 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR1CO15160 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR1CO15160 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR1CO15160 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR1CO15160 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR1CO15160 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR1CO15160 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR1CO15160 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR1CO15160 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR1CO15160 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR1CO15160 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR1CO15160 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR1CO15160 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR1CO15160 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR1CO15160 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR1CO15160 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR1CO15160 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR1CO15160 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms