Protein–RNA interactions for Protein: O15069

NACAD, NAC-alpha domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NACADO15069 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
NACADO15069 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
NACADO15069 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC44.2■■■■■ 4.67
NACADO15069 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC44.19■■■■■ 4.66
NACADO15069 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC44.19■■■■■ 4.66
NACADO15069 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.66
NACADO15069 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
NACADO15069 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
NACADO15069 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
NACADO15069 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC44.18■■■■■ 4.66
NACADO15069 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
NACADO15069 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC44.18■■■■■ 4.66
NACADO15069 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC44.18■■■■■ 4.66
NACADO15069 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC44.18■■■■■ 4.66
NACADO15069 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC44.18■■■■■ 4.66
NACADO15069 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
NACADO15069 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
NACADO15069 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.17■■■■■ 4.66
NACADO15069 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC44.17■■■■■ 4.66
NACADO15069 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.16■■■■■ 4.66
NACADO15069 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC44.16■■■■■ 4.66
NACADO15069 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC44.16■■■■■ 4.66
NACADO15069 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC44.16■■■■■ 4.66
NACADO15069 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC44.16■■■■■ 4.66
NACADO15069 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC44.16■■■■■ 4.66
NACADO15069 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC44.16■■■■■ 4.66
NACADO15069 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
NACADO15069 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
NACADO15069 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC44.15■■■■■ 4.66
NACADO15069 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.15■■■■■ 4.66
NACADO15069 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
NACADO15069 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC44.14■■■■■ 4.66
NACADO15069 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC44.14■■■■■ 4.66
NACADO15069 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
NACADO15069 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC44.14■■■■■ 4.66
NACADO15069 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC44.14■■■■■ 4.66
NACADO15069 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC44.14■■■■■ 4.66
NACADO15069 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.14■■■■■ 4.66
NACADO15069 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC44.14■■■■■ 4.66
NACADO15069 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
NACADO15069 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
NACADO15069 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.14■■■■■ 4.66
NACADO15069 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.65
NACADO15069 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.65
NACADO15069 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.12■■■■■ 4.65
NACADO15069 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC44.12■■■■■ 4.65
NACADO15069 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC44.12■■■■■ 4.65
NACADO15069 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC44.12■■■■■ 4.65
NACADO15069 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC44.12■■■■■ 4.65
NACADO15069 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
NACADO15069 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.11■■■■■ 4.65
NACADO15069 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
NACADO15069 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.11■■■■■ 4.65
NACADO15069 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
NACADO15069 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC44.11■■■■■ 4.65
NACADO15069 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC44.11■■■■■ 4.65
NACADO15069 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC44.11■■■■■ 4.65
NACADO15069 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
NACADO15069 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC44.11■■■■■ 4.65
NACADO15069 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
NACADO15069 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC44.11■■■■■ 4.65
NACADO15069 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
NACADO15069 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
NACADO15069 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.1■■■■■ 4.65
NACADO15069 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
NACADO15069 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC44.1■■■■■ 4.65
NACADO15069 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC44.1■■■■■ 4.65
NACADO15069 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC44.1■■■■■ 4.65
NACADO15069 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
NACADO15069 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
NACADO15069 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC44.1■■■■■ 4.65
NACADO15069 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC44.09■■■■■ 4.65
NACADO15069 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
NACADO15069 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.09■■■■■ 4.65
NACADO15069 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
NACADO15069 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC44.09■■■■■ 4.65
NACADO15069 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC44.09■■■■■ 4.65
NACADO15069 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC44.09■■■■■ 4.65
NACADO15069 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC44.09■■■■■ 4.65
NACADO15069 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC44.08■■■■■ 4.65
NACADO15069 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.08■■■■■ 4.65
NACADO15069 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC44.08■■■■■ 4.65
NACADO15069 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC44.08■■■■■ 4.65
NACADO15069 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC44.08■■■■■ 4.65
NACADO15069 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.07■■■■■ 4.65
NACADO15069 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC44.07■■■■■ 4.65
NACADO15069 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC44.07■■■■■ 4.65
NACADO15069 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.65
NACADO15069 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
NACADO15069 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC44.06■■■■■ 4.64
NACADO15069 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC44.06■■■■■ 4.64
NACADO15069 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
NACADO15069 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC44.06■■■■■ 4.64
NACADO15069 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC44.06■■■■■ 4.64
NACADO15069 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC44.06■■■■■ 4.64
NACADO15069 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
NACADO15069 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
NACADO15069 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
NACADO15069 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
NACADO15069 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC44.06■■■■■ 4.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms