Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SEMA3EO15041 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SEMA3EO15041 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SEMA3EO15041 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SEMA3EO15041 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SEMA3EO15041 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SEMA3EO15041 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SEMA3EO15041 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SEMA3EO15041 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SEMA3EO15041 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SEMA3EO15041 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SEMA3EO15041 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SEMA3EO15041 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SEMA3EO15041 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SEMA3EO15041 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SEMA3EO15041 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SEMA3EO15041 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SEMA3EO15041 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SEMA3EO15041 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SEMA3EO15041 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SEMA3EO15041 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SEMA3EO15041 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SEMA3EO15041 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SEMA3EO15041 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SEMA3EO15041 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SEMA3EO15041 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SEMA3EO15041 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SEMA3EO15041 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SEMA3EO15041 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SEMA3EO15041 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SEMA3EO15041 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SEMA3EO15041 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SEMA3EO15041 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SEMA3EO15041 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SEMA3EO15041 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SEMA3EO15041 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SEMA3EO15041 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SEMA3EO15041 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SEMA3EO15041 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SEMA3EO15041 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SEMA3EO15041 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SEMA3EO15041 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SEMA3EO15041 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SEMA3EO15041 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SEMA3EO15041 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SEMA3EO15041 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SEMA3EO15041 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SEMA3EO15041 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SEMA3EO15041 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SEMA3EO15041 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SEMA3EO15041 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SEMA3EO15041 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SEMA3EO15041 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SEMA3EO15041 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SEMA3EO15041 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SEMA3EO15041 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SEMA3EO15041 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SEMA3EO15041 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SEMA3EO15041 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SEMA3EO15041 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SEMA3EO15041 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SEMA3EO15041 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SEMA3EO15041 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SEMA3EO15041 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SEMA3EO15041 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SEMA3EO15041 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SEMA3EO15041 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SEMA3EO15041 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SEMA3EO15041 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SEMA3EO15041 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SEMA3EO15041 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SEMA3EO15041 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SEMA3EO15041 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SEMA3EO15041 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SEMA3EO15041 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SEMA3EO15041 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SEMA3EO15041 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SEMA3EO15041 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SEMA3EO15041 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SEMA3EO15041 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SEMA3EO15041 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SEMA3EO15041 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SEMA3EO15041 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SEMA3EO15041 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SEMA3EO15041 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SEMA3EO15041 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SEMA3EO15041 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SEMA3EO15041 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SEMA3EO15041 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SEMA3EO15041 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SEMA3EO15041 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SEMA3EO15041 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SEMA3EO15041 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SEMA3EO15041 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SEMA3EO15041 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SEMA3EO15041 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SEMA3EO15041 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SEMA3EO15041 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SEMA3EO15041 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SEMA3EO15041 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms