Protein–RNA interactions for Protein: O14828

SCAMP3, Secretory carrier-associated membrane protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP3O14828 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAMP3O14828 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAMP3O14828 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAMP3O14828 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAMP3O14828 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAMP3O14828 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAMP3O14828 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAMP3O14828 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAMP3O14828 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAMP3O14828 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAMP3O14828 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAMP3O14828 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAMP3O14828 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAMP3O14828 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAMP3O14828 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAMP3O14828 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAMP3O14828 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAMP3O14828 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAMP3O14828 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAMP3O14828 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAMP3O14828 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAMP3O14828 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAMP3O14828 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAMP3O14828 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAMP3O14828 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAMP3O14828 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAMP3O14828 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAMP3O14828 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SCAMP3O14828 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCAMP3O14828 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCAMP3O14828 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCAMP3O14828 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCAMP3O14828 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCAMP3O14828 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAMP3O14828 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAMP3O14828 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAMP3O14828 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAMP3O14828 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAMP3O14828 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAMP3O14828 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAMP3O14828 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAMP3O14828 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAMP3O14828 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAMP3O14828 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAMP3O14828 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAMP3O14828 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAMP3O14828 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAMP3O14828 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAMP3O14828 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAMP3O14828 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAMP3O14828 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAMP3O14828 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAMP3O14828 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAMP3O14828 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAMP3O14828 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAMP3O14828 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAMP3O14828 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAMP3O14828 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAMP3O14828 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAMP3O14828 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAMP3O14828 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAMP3O14828 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAMP3O14828 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAMP3O14828 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAMP3O14828 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAMP3O14828 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAMP3O14828 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAMP3O14828 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAMP3O14828 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAMP3O14828 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAMP3O14828 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAMP3O14828 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAMP3O14828 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAMP3O14828 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAMP3O14828 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAMP3O14828 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAMP3O14828 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAMP3O14828 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAMP3O14828 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAMP3O14828 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAMP3O14828 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAMP3O14828 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAMP3O14828 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAMP3O14828 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCAMP3O14828 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCAMP3O14828 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCAMP3O14828 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCAMP3O14828 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCAMP3O14828 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCAMP3O14828 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCAMP3O14828 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCAMP3O14828 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SCAMP3O14828 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SCAMP3O14828 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SCAMP3O14828 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SCAMP3O14828 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCAMP3O14828 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCAMP3O14828 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCAMP3O14828 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCAMP3O14828 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms