Protein–RNA interactions for Protein: O14815

CAPN9, Calpain-9, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN9O14815 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAPN9O14815 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAPN9O14815 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAPN9O14815 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAPN9O14815 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CAPN9O14815 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAPN9O14815 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAPN9O14815 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAPN9O14815 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAPN9O14815 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPN9O14815 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPN9O14815 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPN9O14815 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPN9O14815 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPN9O14815 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPN9O14815 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPN9O14815 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPN9O14815 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPN9O14815 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPN9O14815 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPN9O14815 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPN9O14815 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPN9O14815 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPN9O14815 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPN9O14815 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPN9O14815 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPN9O14815 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPN9O14815 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPN9O14815 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPN9O14815 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPN9O14815 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN9O14815 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN9O14815 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN9O14815 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN9O14815 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN9O14815 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN9O14815 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN9O14815 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN9O14815 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN9O14815 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN9O14815 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN9O14815 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN9O14815 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN9O14815 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN9O14815 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN9O14815 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN9O14815 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN9O14815 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN9O14815 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN9O14815 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN9O14815 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN9O14815 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN9O14815 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN9O14815 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN9O14815 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN9O14815 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN9O14815 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN9O14815 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN9O14815 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN9O14815 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN9O14815 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CAPN9O14815 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CAPN9O14815 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CAPN9O14815 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CAPN9O14815 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CAPN9O14815 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN9O14815 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN9O14815 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN9O14815 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN9O14815 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN9O14815 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN9O14815 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN9O14815 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN9O14815 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN9O14815 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN9O14815 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN9O14815 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN9O14815 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN9O14815 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN9O14815 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN9O14815 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN9O14815 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN9O14815 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN9O14815 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPN9O14815 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPN9O14815 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPN9O14815 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPN9O14815 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPN9O14815 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPN9O14815 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPN9O14815 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPN9O14815 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPN9O14815 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPN9O14815 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPN9O14815 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPN9O14815 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPN9O14815 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPN9O14815 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPN9O14815 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPN9O14815 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms