Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
APAF1O14727 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
APAF1O14727 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
APAF1O14727 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
APAF1O14727 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
APAF1O14727 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
APAF1O14727 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
APAF1O14727 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
APAF1O14727 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
APAF1O14727 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
APAF1O14727 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
APAF1O14727 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
APAF1O14727 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
APAF1O14727 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
APAF1O14727 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
APAF1O14727 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
APAF1O14727 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
APAF1O14727 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
APAF1O14727 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
APAF1O14727 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
APAF1O14727 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
APAF1O14727 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
APAF1O14727 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
APAF1O14727 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
APAF1O14727 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
APAF1O14727 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
APAF1O14727 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
APAF1O14727 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
APAF1O14727 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
APAF1O14727 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
APAF1O14727 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
APAF1O14727 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
APAF1O14727 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
APAF1O14727 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
APAF1O14727 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
APAF1O14727 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
APAF1O14727 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
APAF1O14727 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
APAF1O14727 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
APAF1O14727 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
APAF1O14727 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
APAF1O14727 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
APAF1O14727 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
APAF1O14727 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
APAF1O14727 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
APAF1O14727 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
APAF1O14727 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
APAF1O14727 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
APAF1O14727 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
APAF1O14727 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
APAF1O14727 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
APAF1O14727 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
APAF1O14727 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
APAF1O14727 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
APAF1O14727 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
APAF1O14727 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
APAF1O14727 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
APAF1O14727 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
APAF1O14727 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
APAF1O14727 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
APAF1O14727 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
APAF1O14727 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
APAF1O14727 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
APAF1O14727 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
APAF1O14727 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
APAF1O14727 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
APAF1O14727 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
APAF1O14727 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
APAF1O14727 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
APAF1O14727 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
APAF1O14727 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
APAF1O14727 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
APAF1O14727 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
APAF1O14727 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
APAF1O14727 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
APAF1O14727 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
APAF1O14727 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
APAF1O14727 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
APAF1O14727 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
APAF1O14727 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
APAF1O14727 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
APAF1O14727 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
APAF1O14727 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
APAF1O14727 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
APAF1O14727 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
APAF1O14727 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
APAF1O14727 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
APAF1O14727 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
APAF1O14727 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
APAF1O14727 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
APAF1O14727 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
APAF1O14727 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
APAF1O14727 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
APAF1O14727 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
APAF1O14727 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
APAF1O14727 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
APAF1O14727 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
APAF1O14727 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
APAF1O14727 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
APAF1O14727 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms