Protein–RNA interactions for Protein: O00746

NME4, Nucleoside diphosphate kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4O00746 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NME4O00746 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME4O00746 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME4O00746 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME4O00746 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME4O00746 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME4O00746 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NME4O00746 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NME4O00746 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NME4O00746 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NME4O00746 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NME4O00746 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NME4O00746 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NME4O00746 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NME4O00746 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NME4O00746 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NME4O00746 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NME4O00746 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NME4O00746 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NME4O00746 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NME4O00746 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NME4O00746 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NME4O00746 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NME4O00746 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NME4O00746 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NME4O00746 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NME4O00746 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NME4O00746 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NME4O00746 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NME4O00746 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NME4O00746 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NME4O00746 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NME4O00746 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NME4O00746 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NME4O00746 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NME4O00746 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NME4O00746 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NME4O00746 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NME4O00746 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NME4O00746 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NME4O00746 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NME4O00746 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NME4O00746 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NME4O00746 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NME4O00746 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NME4O00746 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NME4O00746 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NME4O00746 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NME4O00746 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NME4O00746 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NME4O00746 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NME4O00746 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NME4O00746 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NME4O00746 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NME4O00746 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NME4O00746 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NME4O00746 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NME4O00746 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NME4O00746 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NME4O00746 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NME4O00746 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NME4O00746 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NME4O00746 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NME4O00746 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NME4O00746 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NME4O00746 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NME4O00746 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NME4O00746 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NME4O00746 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NME4O00746 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NME4O00746 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NME4O00746 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NME4O00746 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NME4O00746 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NME4O00746 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NME4O00746 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NME4O00746 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NME4O00746 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NME4O00746 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NME4O00746 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NME4O00746 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NME4O00746 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NME4O00746 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NME4O00746 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NME4O00746 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NME4O00746 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NME4O00746 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NME4O00746 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NME4O00746 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NME4O00746 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NME4O00746 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NME4O00746 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NME4O00746 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NME4O00746 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
NME4O00746 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NME4O00746 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NME4O00746 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NME4O00746 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NME4O00746 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NME4O00746 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms